Asteraceae Genomic Research Platform
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| Amtr02g06674 | ATGGAGTCGATATTAGCAAGGGCGTTGGAGTACACTCTAAAGTACTGGCTCAAATCATTCACTCGAGATCAGTTCAAGTTACAAGGCCGTACCGTTCAGCTCTCCAATTTAGATATAAACGGTGATGCTTTGCATGCGAGTCTCGGATTGCCGCCTGCGTTGAATGTGACAACTGCGAAAGTTGGGAAGTTGGAGATTATACTACCTTATTTCAGCAATGTACAAGTCGAGCCCATTGTTGTACAAATCGATAAGCTTGATTTGGTGTTGGAGGAAAATGATGATTTGGATGCATATGGGAGTACTGACAGTGCACAAACGCCATCAAGTCCTGCAAAAGGCAGCGGTTATGGGTTTGCTGACAAGATTGCAGATGGAATGACATTGGAGGTACGGACAGTTAATCTTTTACTTGAGACTCATGGGGGTGCTAGACGTCGTGGAGGAGCAACTTGGGCATCACCGATGGCGTCTATTACTATTCGCAATCTTTTGCTTTATACCACAAATGAGAACTGGCAGGTTGTAAGTCTTAAGGAAGCGAGGGACTTCTCAAATGACAAGAAGTTTATCTATGTGTTCAAAAAGCTTGAATGGGAGCATCTATCCATCGACCTCCTGCCTCACCCAGATATGTTTGCAGCATTTTCTGAAGGGGCATTTAAGGATGATGATGGTGCTAAGAGGGTATTTTTTGGTGGGGAGCGATTTCTTGAAGGAATATCTGGAGAAGCTTATATTACCATACAAAGAACAGAGCTTAATAGTCCACTAGGTTTGGAACTCCAGTTACATATTACTGAAGCAGTGTGCCCAGCTTTGAGTGAACCAGGATTACGAGCTCTTCTTCGCTTCTTTACGGGACTGTATGTCTGTCTAAATAGAGGAGACGTGAATCCACATGCTCAAGAGCGATCAGCAGAAGCCGCAGGGCATACCCTGGTCTCTATTATGGTGGACCATATATTTTTTTGCATTAAGGATACTGATTTCCGGTTAGAACTGTTGATGCAGTCACTTTTCTTTTCTCGGGCAAGTCTTTCTGATGGAGAAATCACCAAATGCTTAACTCGAGTGATGATTGGTGGTCTGTTTTTGCGGGATACTTTCTCTAGCCCACCATGTGCATTAGTGCAACCATCAATGCAGGATGCTGCAGAGGAACCACTTCACATTCCAGATTTTGGAAAGAATTTCTGTCCTCCAATATATCCTTTAGGGGATCAGCAATGGAAATTAAATGACCATGCTCCACTCATATCCCTTCATAGTCTTCAGTTTATTCCCTCACCTACCCCTCCATCCTTCTCTTCACAAACTGTCATTGACTGTCAGCCTCTTATGATACATCTTCAAGAAGAATCTTGTCTAAGAATATCATCCTTACTAGCTGATGGAATTTTGGTCAATCATGGTGATATTTCACCAGATTTCTCTATCAGCTCACTTGAATTCAAAGTCAAAGGATTATATATCACTGTTCCACTAGTAAATGAGAGCTCCTTCACTGGAGCAAGGCTTCATATTGAGAACTTATACTTTCAAGACTCCCCTTCCCTAAGACTCAAACTACTCAATCTTGAAAAAGATCCTGCGTGCTTCTGTCTATGGAAAGGCCAGCCCATTGATTCCAGCCAAAAGAAGTGGACAAGTGGCGCTTCTCTTATAAATATGTCTCTAGAAACATGTAATAATAATTCGAAAAATGTTAATGGATCCCGTTCACACTCTTCAGAATTATGGAGATGTGTAGAGATGAAAGGTGTTTGCATTCAGGTAGCAATGGTCACAGCAGATGGAAGCCCGTTAACTGATGTCCCTCCCCCAGGAGGTGTTGTTAGGGTTGGAGTTGCTTGTGAACAATATCTTTCCAACACCTCTGTTGAACAATTATTCTTTGTGTTGGATCTGTATACTTATTTTGGTACAGTCAGTGAGAAAATGGCCAAGGTTGGAAAAGATAAACAAAAAAAATCGGTTAAACGTGAGTTATCGGATGGAAGTTTGATTGAAAAAGTTCCTGGTGATACTGCGGTCAGCTTATCAGTTAAGGACCTAAAGTTAACGTTTCTAGAATCTTCATCTTTGGATATTCAGGGAATGCCTTTAGTTCAGTTTGTTGGTGATGATTTGTTCATGGAAGTTACTCATAGGACCTTGGGTGGGGCCATGGCTATTTCATCAACTTTAAGGTGGGACCAGGTCCAGGTGGACTGTACAGAGACTGAGGGAATTTCGATAAACGCAAATGGTGTAATGCCAAATGACCATCATAAATTGAGAGCTGTATTTTGGGTGCAAAATGGAAGGAGTTTTCCATTTTTGGATTTACGTATGGTACATGTTATTCCGTATAATGCACGGGATATGGAGTGCCATAGTTTAAATGTGTCGGCCTGTATAGCAGGTGTACGTCTTGCTGGTGGAATGAACTATGCTGAAGCTTTGCTCCACCGGTTTGGAATTCTAGGACCAGATGGTGGACCAGGGGCTGGGCTTTCTAAGGGTTTGGAGCATTTATCATCTGGCCCATTTTCAAAGCTTTTCAAAGCATCACCTCTGCTCGAGAGTAAAAGTGAAAAAGAGGAAGAGAAGCATAGTGGTTATTTGCAGTTGGGTCCACCAGATGATGTGGATGTTTCATTAGAATTGAAAGACTGGTTATTTGCACTGGAGGGTGCTGAGATGGCAGAAAAATGGTGGTTCTACAATTCAGAAGATTCTTACAGAGAAGAGAGGTGCTGGCACACAACTTTTGACAGTCTTAAAGTTAAAGCAAACAGCAGCAAAAAACAATCACTTAATAGCAAAAAGATTTTGCCTGGAGCATTTAAGTATCCTATTGAATCAGTGACGGTTGGTGTTGAAGGCTTGAAGACATTGAAACCCCAGAAGCAAAAAGCAATTGCACTCTCAAACGGGCACACGCAAGCTGTCGAGTCACATGGTGGGGTTGATCTCGAAGCTGACATAGTGTTAAGTGAAGATGATGGTGCCAATGAGACGATCAAATGGGTGGTGGAAAGCTTAAAGTTTTCTGTGAAACAGCCGGTTGAGGCAATTGTAACCAAGGATGAACTGCAACATGTTGCCCAGCTATGCAAGTCAGAAGTGGATTCCATGGGGCGAATAACTGCTGGGGTTTTGCGTGTGTTAAAGTTGGAAGGATCAGTTGGTCAGACGGCAATGGATAAGCTAAGCAACCTCGGAAGTGAAGGGTTTGACATCTTCTCACGCAGAGATTGTAACGGTTCTAGTGTCGGCTTGATTCCCTCTTCTCTTTTGGCTTCAGATAACCGACATTCTTCTTCCTCCGATCCAACACTAAATTCACTTGAGGCTGCTTTATTAGATTCACAATCAAATTGTGCAGCTCTTGCGGCCGAATTAAGCAGTTCTGAATCTTCCAAACACCACCTTAGTAGTGTAGAAGAACTTTCCCAGAAACTGGATCGTATGCAGAAATTGTTATCAGAGTTGCAGAGCCGGGTATAA | 3495 | 42.58 | MESILARALEYTLKYWLKSFTRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHASLGLPPALNVTTAKVGKLEIILPYFSNVQVEPIVVQIDKLDLVLEENDDLDAYGSTDSAQTPSSPAKGSGYGFADKIADGMTLEVRTVNLLLETHGGARRRGGATWASPMASITIRNLLLYTTNENWQVVSLKEARDFSNDKKFIYVFKKLEWEHLSIDLLPHPDMFAAFSEGAFKDDDGAKRVFFGGERFLEGISGEAYITIQRTELNSPLGLELQLHITEAVCPALSEPGLRALLRFFTGLYVCLNRGDVNPHAQERSAEAAGHTLVSIMVDHIFFCIKDTDFRLELLMQSLFFSRASLSDGEITKCLTRVMIGGLFLRDTFSSPPCALVQPSMQDAAEEPLHIPDFGKNFCPPIYPLGDQQWKLNDHAPLISLHSLQFIPSPTPPSFSSQTVIDCQPLMIHLQEESCLRISSLLADGILVNHGDISPDFSISSLEFKVKGLYITVPLVNESSFTGARLHIENLYFQDSPSLRLKLLNLEKDPACFCLWKGQPIDSSQKKWTSGASLINMSLETCNNNSKNVNGSRSHSSELWRCVEMKGVCIQVAMVTADGSPLTDVPPPGGVVRVGVACEQYLSNTSVEQLFFVLDLYTYFGTVSEKMAKVGKDKQKKSVKRELSDGSLIEKVPGDTAVSLSVKDLKLTFLESSSLDIQGMPLVQFVGDDLFMEVTHRTLGGAMAISSTLRWDQVQVDCTETEGISINANGVMPNDHHKLRAVFWVQNGRSFPFLDLRMVHVIPYNARDMECHSLNVSACIAGVRLAGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGAGLSKGLEHLSSGPFSKLFKASPLLESKSEKEEEKHSGYLQLGPPDDVDVSLELKDWLFALEGAEMAEKWWFYNSEDSYREERCWHTTFDSLKVKANSSKKQSLNSKKILPGAFKYPIESVTVGVEGLKTLKPQKQKAIALSNGHTQAVESHGGVDLEADIVLSEDDGANETIKWVVESLKFSVKQPVEAIVTKDELQHVAQLCKSEVDSMGRITAGVLRVLKLEGSVGQTAMDKLSNLGSEGFDIFSRRDCNGSSVGLIPSSLLASDNRHSSSSDPTLNSLEAALLDSQSNCAALAAELSSSESSKHHLSSVEELSQKLDRMQKLLSELQSRV | 1164 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Amtr02g06674 | 1164 | Coils | Coil | 1143 | 1163 | - | - | |
| Amtr02g06674 | 1164 | PANTHER | UNCHARACTERIZED | 1 | 745 | IPR026728 | - | |
| Amtr02g06674 | 1164 | Coils | Coil | 1109 | 1129 | - | - | |
| Amtr02g06674 | 1164 | Pfam | VPS13-like, N-terminal | 1 | 99 | IPR026854 | - |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Amtr02g06674 | - | - |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | E-value | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 199678 | Amtr | Amtr02g06674 | Amtr-Chr2:120457669 | Amtr03g03614 | Amtr-Chr3:74738826 |