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Gene details

leaf

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Amtr02g06674 ATGGAGTCGATATTAGCAAGGGCGTTGGAGTACACTCTAAAGTACTGGCTCAAATCATTCACTCGAGATCAGTTCAAGTTACAAGGCCGTACCGTTCAGCTCTCCAATTTAGATATAAACGGTGATGCTTTGCATGCGAGTCTCGGATTGCCGCCTGCGTTGAATGTGACAACTGCGAAAGTTGGGAAGTTGGAGATTATACTACCTTATTTCAGCAATGTACAAGTCGAGCCCATTGTTGTACAAATCGATAAGCTTGATTTGGTGTTGGAGGAAAATGATGATTTGGATGCATATGGGAGTACTGACAGTGCACAAACGCCATCAAGTCCTGCAAAAGGCAGCGGTTATGGGTTTGCTGACAAGATTGCAGATGGAATGACATTGGAGGTACGGACAGTTAATCTTTTACTTGAGACTCATGGGGGTGCTAGACGTCGTGGAGGAGCAACTTGGGCATCACCGATGGCGTCTATTACTATTCGCAATCTTTTGCTTTATACCACAAATGAGAACTGGCAGGTTGTAAGTCTTAAGGAAGCGAGGGACTTCTCAAATGACAAGAAGTTTATCTATGTGTTCAAAAAGCTTGAATGGGAGCATCTATCCATCGACCTCCTGCCTCACCCAGATATGTTTGCAGCATTTTCTGAAGGGGCATTTAAGGATGATGATGGTGCTAAGAGGGTATTTTTTGGTGGGGAGCGATTTCTTGAAGGAATATCTGGAGAAGCTTATATTACCATACAAAGAACAGAGCTTAATAGTCCACTAGGTTTGGAACTCCAGTTACATATTACTGAAGCAGTGTGCCCAGCTTTGAGTGAACCAGGATTACGAGCTCTTCTTCGCTTCTTTACGGGACTGTATGTCTGTCTAAATAGAGGAGACGTGAATCCACATGCTCAAGAGCGATCAGCAGAAGCCGCAGGGCATACCCTGGTCTCTATTATGGTGGACCATATATTTTTTTGCATTAAGGATACTGATTTCCGGTTAGAACTGTTGATGCAGTCACTTTTCTTTTCTCGGGCAAGTCTTTCTGATGGAGAAATCACCAAATGCTTAACTCGAGTGATGATTGGTGGTCTGTTTTTGCGGGATACTTTCTCTAGCCCACCATGTGCATTAGTGCAACCATCAATGCAGGATGCTGCAGAGGAACCACTTCACATTCCAGATTTTGGAAAGAATTTCTGTCCTCCAATATATCCTTTAGGGGATCAGCAATGGAAATTAAATGACCATGCTCCACTCATATCCCTTCATAGTCTTCAGTTTATTCCCTCACCTACCCCTCCATCCTTCTCTTCACAAACTGTCATTGACTGTCAGCCTCTTATGATACATCTTCAAGAAGAATCTTGTCTAAGAATATCATCCTTACTAGCTGATGGAATTTTGGTCAATCATGGTGATATTTCACCAGATTTCTCTATCAGCTCACTTGAATTCAAAGTCAAAGGATTATATATCACTGTTCCACTAGTAAATGAGAGCTCCTTCACTGGAGCAAGGCTTCATATTGAGAACTTATACTTTCAAGACTCCCCTTCCCTAAGACTCAAACTACTCAATCTTGAAAAAGATCCTGCGTGCTTCTGTCTATGGAAAGGCCAGCCCATTGATTCCAGCCAAAAGAAGTGGACAAGTGGCGCTTCTCTTATAAATATGTCTCTAGAAACATGTAATAATAATTCGAAAAATGTTAATGGATCCCGTTCACACTCTTCAGAATTATGGAGATGTGTAGAGATGAAAGGTGTTTGCATTCAGGTAGCAATGGTCACAGCAGATGGAAGCCCGTTAACTGATGTCCCTCCCCCAGGAGGTGTTGTTAGGGTTGGAGTTGCTTGTGAACAATATCTTTCCAACACCTCTGTTGAACAATTATTCTTTGTGTTGGATCTGTATACTTATTTTGGTACAGTCAGTGAGAAAATGGCCAAGGTTGGAAAAGATAAACAAAAAAAATCGGTTAAACGTGAGTTATCGGATGGAAGTTTGATTGAAAAAGTTCCTGGTGATACTGCGGTCAGCTTATCAGTTAAGGACCTAAAGTTAACGTTTCTAGAATCTTCATCTTTGGATATTCAGGGAATGCCTTTAGTTCAGTTTGTTGGTGATGATTTGTTCATGGAAGTTACTCATAGGACCTTGGGTGGGGCCATGGCTATTTCATCAACTTTAAGGTGGGACCAGGTCCAGGTGGACTGTACAGAGACTGAGGGAATTTCGATAAACGCAAATGGTGTAATGCCAAATGACCATCATAAATTGAGAGCTGTATTTTGGGTGCAAAATGGAAGGAGTTTTCCATTTTTGGATTTACGTATGGTACATGTTATTCCGTATAATGCACGGGATATGGAGTGCCATAGTTTAAATGTGTCGGCCTGTATAGCAGGTGTACGTCTTGCTGGTGGAATGAACTATGCTGAAGCTTTGCTCCACCGGTTTGGAATTCTAGGACCAGATGGTGGACCAGGGGCTGGGCTTTCTAAGGGTTTGGAGCATTTATCATCTGGCCCATTTTCAAAGCTTTTCAAAGCATCACCTCTGCTCGAGAGTAAAAGTGAAAAAGAGGAAGAGAAGCATAGTGGTTATTTGCAGTTGGGTCCACCAGATGATGTGGATGTTTCATTAGAATTGAAAGACTGGTTATTTGCACTGGAGGGTGCTGAGATGGCAGAAAAATGGTGGTTCTACAATTCAGAAGATTCTTACAGAGAAGAGAGGTGCTGGCACACAACTTTTGACAGTCTTAAAGTTAAAGCAAACAGCAGCAAAAAACAATCACTTAATAGCAAAAAGATTTTGCCTGGAGCATTTAAGTATCCTATTGAATCAGTGACGGTTGGTGTTGAAGGCTTGAAGACATTGAAACCCCAGAAGCAAAAAGCAATTGCACTCTCAAACGGGCACACGCAAGCTGTCGAGTCACATGGTGGGGTTGATCTCGAAGCTGACATAGTGTTAAGTGAAGATGATGGTGCCAATGAGACGATCAAATGGGTGGTGGAAAGCTTAAAGTTTTCTGTGAAACAGCCGGTTGAGGCAATTGTAACCAAGGATGAACTGCAACATGTTGCCCAGCTATGCAAGTCAGAAGTGGATTCCATGGGGCGAATAACTGCTGGGGTTTTGCGTGTGTTAAAGTTGGAAGGATCAGTTGGTCAGACGGCAATGGATAAGCTAAGCAACCTCGGAAGTGAAGGGTTTGACATCTTCTCACGCAGAGATTGTAACGGTTCTAGTGTCGGCTTGATTCCCTCTTCTCTTTTGGCTTCAGATAACCGACATTCTTCTTCCTCCGATCCAACACTAAATTCACTTGAGGCTGCTTTATTAGATTCACAATCAAATTGTGCAGCTCTTGCGGCCGAATTAAGCAGTTCTGAATCTTCCAAACACCACCTTAGTAGTGTAGAAGAACTTTCCCAGAAACTGGATCGTATGCAGAAATTGTTATCAGAGTTGCAGAGCCGGGTATAA 3495 42.58 MESILARALEYTLKYWLKSFTRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHASLGLPPALNVTTAKVGKLEIILPYFSNVQVEPIVVQIDKLDLVLEENDDLDAYGSTDSAQTPSSPAKGSGYGFADKIADGMTLEVRTVNLLLETHGGARRRGGATWASPMASITIRNLLLYTTNENWQVVSLKEARDFSNDKKFIYVFKKLEWEHLSIDLLPHPDMFAAFSEGAFKDDDGAKRVFFGGERFLEGISGEAYITIQRTELNSPLGLELQLHITEAVCPALSEPGLRALLRFFTGLYVCLNRGDVNPHAQERSAEAAGHTLVSIMVDHIFFCIKDTDFRLELLMQSLFFSRASLSDGEITKCLTRVMIGGLFLRDTFSSPPCALVQPSMQDAAEEPLHIPDFGKNFCPPIYPLGDQQWKLNDHAPLISLHSLQFIPSPTPPSFSSQTVIDCQPLMIHLQEESCLRISSLLADGILVNHGDISPDFSISSLEFKVKGLYITVPLVNESSFTGARLHIENLYFQDSPSLRLKLLNLEKDPACFCLWKGQPIDSSQKKWTSGASLINMSLETCNNNSKNVNGSRSHSSELWRCVEMKGVCIQVAMVTADGSPLTDVPPPGGVVRVGVACEQYLSNTSVEQLFFVLDLYTYFGTVSEKMAKVGKDKQKKSVKRELSDGSLIEKVPGDTAVSLSVKDLKLTFLESSSLDIQGMPLVQFVGDDLFMEVTHRTLGGAMAISSTLRWDQVQVDCTETEGISINANGVMPNDHHKLRAVFWVQNGRSFPFLDLRMVHVIPYNARDMECHSLNVSACIAGVRLAGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGAGLSKGLEHLSSGPFSKLFKASPLLESKSEKEEEKHSGYLQLGPPDDVDVSLELKDWLFALEGAEMAEKWWFYNSEDSYREERCWHTTFDSLKVKANSSKKQSLNSKKILPGAFKYPIESVTVGVEGLKTLKPQKQKAIALSNGHTQAVESHGGVDLEADIVLSEDDGANETIKWVVESLKFSVKQPVEAIVTKDELQHVAQLCKSEVDSMGRITAGVLRVLKLEGSVGQTAMDKLSNLGSEGFDIFSRRDCNGSSVGLIPSSLLASDNRHSSSSDPTLNSLEAALLDSQSNCAALAAELSSSESSKHHLSSVEELSQKLDRMQKLLSELQSRV 1164
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Amtr02g06674 1164 Coils Coil 1143 1163 - -
Amtr02g06674 1164 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 745 IPR026728 -
Amtr02g06674 1164 Coils Coil 1109 1129 - -
Amtr02g06674 1164 Pfam VPS13-like, N-terminal 1 99 IPR026854 -
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Amtr02g06674 - -
leaf

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
199678 Amtr Amtr02g06674 Amtr-Chr2:120457669 Amtr03g03614 Amtr-Chr3:74738826