Asteraceae Genomic Research Platform
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Bial12g02319 | ATGAATATGAAGTACCCATCAAGCGATGGAAATGGTGGTGCAAATGGGATCATAAAACATAAGAGGAAGTGCAGAGATGTTGTGTTTCTTGTTCTGTTTATAGCTTTCTGGATTGCCATGATTGTTAACTCCAGCTTTGGATTCAACCAAGGAAACCCATTGAGGCTAAACTTTGGATTAGATTACAAAGGAAATGTATGTGGAGGCAAACACAAAGATTTCAACCTTCGCGAATTGGAACTCAAATATTATGTTAATCCTAATCAAGTTTACCAAAGTGGAATAAAAAACAGTGGAGTGCAACTATCTAATGCACGGACAATATGTTTAATGGATTGCCCGATACCATCAGAAGATTCTTTAAATTGGGTTTGCGATTATCCGGAGGGAGATATTCGTCTTTCGTTAGATGATTGGATTGATATGAATTATGATTATTTTGCTGACCTCACTCCTGAATTAAGAAACACTTCTCTTCAACTTCAAGGGCCTTGTTACCCTGTCATTTTTCCTAGCGTAAACGTTTATTGGAGTTGCCAGTTTATTGATCGGCCATCAAACGTGTCGTTAACACATTGGAAGCAAATGAATGGAGTTACTATTAATGATGATATGGTCATAGATAAATCTATTCACAAGTCCATCAATGCACGGTCTTCGGTATTGAAGAGATATGTTGCTGATGTTGGGAAATCATGGCCCGTGTTGATTGTGTGTGGAGGACTCTTGCCTCTACTTTTATCAATGCTATGGCTTTTAATGATTCGACATTTTGTAGCCGCGATGCCATGGGTTACAGTGTTTTTATTTAACGGCCTCATAATATCAGTTACAATGTTCTACTACTTGAAAGCTGGATGGATCGGGAACGATGCTATCTCGCCCATCATTGGTGAACATGATCCATACTATCATGTTTCTGCAAGGGAGCTACATCATATCCGTGCAGCTGCGTTTCTCATGACTTGTGTTATGATTGTTGCGGTCCTATCATCTATAGCTATTGTTAGGCGGATTCTTATGGCAACCTCAGTACTCAAGGTTGCAGCAAAGGTTATTGGAGAAGTTGATGCTCTAATAATATTCCCTGTTATACCATACACAATCCTCACAATTTTTTACATGTTTTGGTTATCGGCGGCTCTAAATCTTTTTAGCTCGGGTCAAATAGTCAACAATGACTGCAACACGAATTGCTGTGCTTATGATCTTAAAGCCAAACGAGTGAATTGTAACGATTGTTGCGGCTATAGTATCTATTACACCCCGCATATTGGAGCTTCAATATTATTCCACTTGTTTGGATGCTATTGGGCCACTCAGTTTATTATTGCGTGTTCGTCAACTGTGATTGCTGGTTCTGTAGCTTCATATTATTGGGCCCGTGGGGAATCTTCGGCAACGATTCCATTTCTTCCGGTTTTTTCATCAATGAAGCTACTCATGAGATATAGCTTAGGGTCGGTGGCGATCGGGTCCTTGGTTGTGTCGTTTGTTGAGTCGGCTCGGTTCATACTTGAGGCCATACGCCGGAGACTAAAAGTTGCTGACATCATGCCTGAAAGTTGGATTAAGCGAATGATGTTTTATACTTCCCGATTTTGCTTAAAATGCATTGAGTTGACCGTAAAATGTGTGAACCGCAATGCATATATTATGATTGCTATAACTGGAAAAGGGTTCTTTAGAGCTTCGGAAATGGCGACGGATTTGATAATTAGTAATATTCTGCGTATAGGCCGAGTAAACGTAATCGGGGACGTTATTCTCTTTCTTGGAAAGCTATGTGTGAGTCTTGCAAGTGCACTTTTTGCATTTCTCATGTTGGATACTCACAAATACAAATCATCCCACAACAAGATTACATCCCCATTACTTCCTGTGCTGGCGTGTTGGGGGCTCGGGTACGTGGTGGCTACCCTTTTCTTTGCGGTTGTTGAAATGTCGATTGATACGATTATACTTTCGTACTGTCAAGATTCGGAGGAACATCAAGGGACCGCGCATTATGCGCCTTCACTTTTGATTGAAACATTTGATGAACAAAATGAGTTGCCAAGAATTGGACAATGA | 2073 | 40.38 | MNMKYPSSDGNGGANGIIKHKRKCRDVVFLVLFIAFWIAMIVNSSFGFNQGNPLRLNFGLDYKGNVCGGKHKDFNLRELELKYYVNPNQVYQSGIKNSGVQLSNARTICLMDCPIPSEDSLNWVCDYPEGDIRLSLDDWIDMNYDYFADLTPELRNTSLQLQGPCYPVIFPSVNVYWSCQFIDRPSNVSLTHWKQMNGVTINDDMVIDKSIHKSINARSSVLKRYVADVGKSWPVLIVCGGLLPLLLSMLWLLMIRHFVAAMPWVTVFLFNGLIISVTMFYYLKAGWIGNDAISPIIGEHDPYYHVSARELHHIRAAAFLMTCVMIVAVLSSIAIVRRILMATSVLKVAAKVIGEVDALIIFPVIPYTILTIFYMFWLSAALNLFSSGQIVNNDCNTNCCAYDLKAKRVNCNDCCGYSIYYTPHIGASILFHLFGCYWATQFIIACSSTVIAGSVASYYWARGESSATIPFLPVFSSMKLLMRYSLGSVAIGSLVVSFVESARFILEAIRRRLKVADIMPESWIKRMMFYTSRFCLKCIELTVKCVNRNAYIMIAITGKGFFRASEMATDLIISNILRIGRVNVIGDVILFLGKLCVSLASALFAFLMLDTHKYKSSHNKITSPLLPVLACWGLGYVVATLFFAVVEMSIDTIILSYCQDSEEHQGTAHYAPSLLIETFDEQNELPRIGQ | 690 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Bial12g02319 | 690 | PANTHER | CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) | 15 | 680 | IPR007603 | GO:0022857(InterPro)|GO:0055085(InterPro) | |
| Bial12g02319 | 690 | Pfam | Plasma-membrane choline transporter | 320 | 662 | IPR007603 | GO:0022857(InterPro)|GO:0055085(InterPro) |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Bial12g02319 | - | - |
| Select | Gene_1 | Gene_2 | Event_name |
|---|---|---|---|
| 184671 | Bial12g02319 | Bial24g02181 | |
| 363313 | Bial12g02319 | Bial24g02181 | |
| 363314 | Bial12g02319 | Bial4g03276 |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|
| Bial | Bial-Chr12:53467912 | Bial14g02083 | Bial-Chr14:54195462 | dispersed | |
| Bial | Bial-Chr12:53467912 | Bial24g02181 | Bial-Chr24:52333324 | wgd | |
| Bial | Bial-Chr12:53467912 | Bial4g03276 | Bial-Chr4:75184511 | wgd |