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Gene details

leaf

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Ceso2g01456 ATGTCTTCTTCTTCTCTCAAACCCACTCTTGATCTTCCTCCTTCTGGCGAGATCCACGTCATTGTGGGCCCCATGTTCGCCGGCAAGACCACTGCCCTTCTTCGCAGGATCAAATCTGAAGGAATCAATGGCAGGAAAGTAGCAATGATAAAGTCAAGCAAAGATAACCGATATGCGATTGATTCAGTTGTAACCCATGATGGAACTAAGTACCCATGTATGGCACTCCCTGATCTCTTGTCTTTTAAGCAAAAACTTGGAGAAGAAGCTTATGAAAAGCTGGATGTTATTGGCATAGATGAGGCCCAATTCTTTGATGATCTCTATGACTTTTGTTGTAAAGCTGCTGACCATGATGGAAAAACTGTTATAGTTGCTGGTCTTGATGGTGATTACTTAAGAAGGAACTTCGGTCCAGTTCTTGATCTAGTACCACTTGCTGACACCATAACCAAATTAACTGCCCGATGTGAACTATGCGGCAAACGAGCCCACTTCACCTTACGGAAGACTCACGAGACAAAAACGGAACTCATAGGTGGTGCAGATGTCTATATGCCCGTTTGCCGTCAGCATTATGTTAACGGACAAATAGTGATCAAAGCTGCTAGAAACATAATAGACGAATCTACCAAGTTTCAAAGCGAACAAGAGCCAGAAGTGATCTCAACAACTTTAACTTAA 684 42.84 MSSSSLKPTLDLPPSGEIHVIVGPMFAGKTTALLRRIKSEGINGRKVAMIKSSKDNRYAIDSVVTHDGTKYPCMALPDLLSFKQKLGEEAYEKLDVIGIDEAQFFDDLYDFCCKAADHDGKTVIVAGLDGDYLRRNFGPVLDLVPLADTITKLTARCELCGKRAHFTLRKTHETKTELIGGADVYMPVCRQHYVNGQIVIKAARNIIDESTKFQSEQEPEVISTTLT 227
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Ceso2g01456 227 PANTHER THYMIDINE KINASE 14 215 IPR001267 GO:0004797(PANTHER)|GO:0004797(InterPro)|GO:0005524(InterPro)|GO:0046104(PANTHER)
Ceso2g01456 227 Pfam Thymidine kinase 16 193 IPR001267 GO:0004797(InterPro)|GO:0005524(InterPro)
Ceso2g01456 227 ProSitePatterns Thymidine kinase cellular-type signature. 180 193 IPR020633 GO:0004797(InterPro)|GO:0005524(InterPro)
Ceso2g01456 227 Gene3D - 154 195 - -
Ceso2g01456 227 FunFam Thymidine kinase 154 196 - -
Ceso2g01456 227 SUPERFAMILY Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain) 154 196 - -
Ceso2g01456 227 PIRSF Tdk 14 206 IPR001267 GO:0004797(InterPro)|GO:0005524(InterPro)
Ceso2g01456 227 FunFam Thymidine kinase 13 153 - -
Ceso2g01456 227 SUPERFAMILY P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases 16 154 IPR027417 -
Ceso2g01456 227 Gene3D - 12 153 IPR027417 -
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Ceso2g01456 K00857 thymidine kinase [EC:2.7.1.21]
leaf

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 Duplicated-type
Ceso Ceso-Chr7:36685027 Ceso2g01456 Ceso-Chr2:30365065 dispersed
Ceso Ceso-Chr1:70600183 Ceso2g01456 Ceso-Chr2:30365065 wgd