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Gene details

leaf

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Ceso2g01612 ATGGCAGATCAAGTGTTGGAGGGTAGCCAACCAGTTGATCTCTCCAAGCACCCATCTGGAATTGTTCCTACTCTTCAGAACATTGTGTCTACTGTCAATCTCGACTGCAAGCTAGACCTCAAGGCAATTGCACTGCAAGCTCGTAATGCAGAATATAATCCGAAGCGTTTTGCTGCTGTAATCATGAGGATAAGAGAACCAAAAACGACGGCTTTAATCTTTGCTTCTGGGAAAATGGTATGTACAGGAGCCAAGAGCGAACAGCAATCCAAACTTGCGGCACGGAAGTATGCTCGGATTATTCAGAAACTTGGGTTTCCAGCCAAATTTAAGGATTTCAAAATTCAGAACATTGTGGGCTCATGTGACGTAAAATTTCCCATTAGACTCGAAGGCCTTGCATACTCTCATGGTGCCTTTTCAAGTTATGAACCAGAACTGTTCCCTGGATTGATATATCGGATGAAACAACCAAAAATCGTTCTGCTTATTTTTGTTTCTGGGAAAATTGTTCTTACAGGCGCCAAGGTCAGAGACGAGACTTATACTGCATTTGAGAACATATATCCCGTCCTTACTGAATTCAGAAAGAATCAGCAGTGGTACAACGCCCCTCTCTCCTAA 624 42.95 MADQVLEGSQPVDLSKHPSGIVPTLQNIVSTVNLDCKLDLKAIALQARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVCTGAKSEQQSKLAARKYARIIQKLGFPAKFKDFKIQNIVGSCDVKFPIRLEGLAYSHGAFSSYEPELFPGLIYRMKQPKIVLLIFVSGKIVLTGAKVRDETYTAFENIYPVLTEFRKNQQWYNAPLS 207
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Ceso2g01612 207 Gene3D - 26 194 IPR012295 -
Ceso2g01612 207 SUPERFAMILY TATA-box binding protein-like 21 114 - -
Ceso2g01612 207 CDD TBP-eukaryotes 22 195 IPR033710 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 ProSitePatterns Transcription factor TFIID repeat signature. 143 192 IPR030491 -
Ceso2g01612 207 Hamap TATA-box-binding protein [tbp]. 19 198 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 FunFam TATA-box-binding protein 2 114 195 - -
Ceso2g01612 207 Pfam Transcription factor TFIID (or TATA-binding protein, TBP) 112 195 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 Pfam Transcription factor TFIID (or TATA-binding protein, TBP) 23 104 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 FunFam TATA-box-binding protein 2 30 113 - -
Ceso2g01612 207 PRINTS Transcription initiation factor TFIID signature 25 40 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 PRINTS Transcription initiation factor TFIID signature 115 131 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 PRINTS Transcription initiation factor TFIID signature 139 154 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 PRINTS Transcription initiation factor TFIID signature 68 86 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 PRINTS Transcription initiation factor TFIID signature 49 68 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 PRINTS Transcription initiation factor TFIID signature 158 174 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(InterPro)
Ceso2g01612 207 PANTHER TATA-BOX BINDING PROTEIN 9 200 IPR000814 GO:0003677(InterPro)|GO:0006352(PANTHER)|GO:0006352(InterPro)|GO:0016251(PANTHER)|GO:0140223(PANTHER)
Ceso2g01612 207 SUPERFAMILY TATA-box binding protein-like 112 203 - -
Ceso2g01612 207 Gene3D - 30 115 IPR012295 -
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Ceso2g01612 K03120 transcription initiation factor TFIID TATA-box-binding protein
leaf

Event-related genes

Select Gene_1 Gene_2 Event_name
40269 Ceso2g01612 Ceso4g01827
40270 Ceso2g01612 Ceso8g01109
leaf

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 Duplicated-type
Ceso Ceso-Chr2:34149239 Ceso4g01896 Ceso-Chr4:34447338 dispersed
Ceso Ceso-Chr2:34149239 Ceso4g01827 Ceso-Chr4:32918038 wgd
Ceso Ceso-Chr2:34149239 Ceso8g01109 Ceso-Chr8:15557481 wgd