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Gene details

leaf

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Ceso2g03309 ATGTCCAGAAGATCCGGCGACTCACCGCCGGAAAAGATCATCTACACCTACGGCATCGACATCCTCTCCGGCGACTATTCCGGCCAACAAACACTCCAATCCACACCGACGAACATGGCGGAATCCATCGCAGCCGTTGAATCGATCCTAGACTACACATTCAACGACAAATCTCTGCTAGTAGAAGCCCTAACTCATCCTTCGTACTCCGGCAGTCCTTCCTACCAACGCCTCGAGTTCGTCGGAGATGCCGTCCTAGGGCTCGTGGTCTCCGATTTCGTCTTCGTAACTTATCCCGATCTCGACCCTGGCCAGCTGTCTCTTCTTCGTTCAGCCAATATCAGTACGGAAAAGCTGGCTAGGGTTGCGGTTAAGCATGGACTTCATAAGTATGTCCGCCATCGGGCCGCTGCTCTTAGTGAGAAGGTTAGGGAATTTGTGATTGCGGTTGAGGAAGAAGATGATATGGTTGTTCACGGTGGACATATGAAAGCCCCTAAGGTACTTGCTGATATCGTGGAATCGGTGGTTGCAGCTGTTTATCTGGATTGTGGATCAAACTTGAAAATCCTAAGGATGATCATTAGAGTGCTACTTGAACCTCTTGTGACGCTAAATGACATTGAGGAACAACCGCAGCCTATTACGTTGCTCTACGAGGCATGTCAGAAGGATCAGAAGAATGTTATTATAAGGCACTGGAGGAAAGGTGATAAAAACATCGCTAGTGTTTACGTGGATGGCAGATTTGTTGCATCCGGTTCTTCAGAGAACAAAGAAAATGCAAAACTTCATGCAGCCGAGGCTGCTTTGTCCAAGCTAAGAAGTTCGAAAAGCAGCGTCTATGATGATTTTGTTAAAAACATAGAGATTGAACGGGCCAAACAGAGAGTATTCGAGCTTTGCAATAAGAAAAGATGGTCCACACCGATTTACAGGTATGCGATTGTTCTATGTTATATAAAAATCGAGCATCAGTCGGGACCAGCACACGATAGAAGACATACATCGGCGGTTAAAATTGTAATTTGTGACGTGATTCTTGACGTGATGGGAGAGGAGAAGCCTAGAGTCAAGGAAGCGGAGAATTCTGCAGCCGTTGCAATGCTATGTGCTCTGCGAGAATCTGGATTTATATGA 1140 46.58 MSRRSGDSPPEKIIYTYGIDILSGDYSGQQTLQSTPTNMAESIAAVESILDYTFNDKSLLVEALTHPSYSGSPSYQRLEFVGDAVLGLVVSDFVFVTYPDLDPGQLSLLRSANISTEKLARVAVKHGLHKYVRHRAAALSEKVREFVIAVEEEDDMVVHGGHMKAPKVLADIVESVVAAVYLDCGSNLKILRMIIRVLLEPLVTLNDIEEQPQPITLLYEACQKDQKNVIIRHWRKGDKNIASVYVDGRFVASGSSENKENAKLHAAEAALSKLRSSKSSVYDDFVKNIEIERAKQRVFELCNKKRWSTPIYRYAIVLCYIKIEHQSGPAHDRRHTSAVKIVICDVILDVMGEEKPRVKEAENSAAVAMLCALRESGFI 379
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Ceso2g03309 379 ProSiteProfiles Double stranded RNA-binding domain (dsRBD) profile. 200 276 IPR014720 -
Ceso2g03309 379 Gene3D Ribonuclease III domain 31 206 IPR036389 GO:0004525(InterPro)|GO:0006396(InterPro)
Ceso2g03309 379 Gene3D - 209 283 - -
Ceso2g03309 379 ProSitePatterns Ribonuclease III family signature. 76 84 IPR000999 GO:0004525(InterPro)|GO:0006396(InterPro)
Ceso2g03309 379 Gene3D - 300 375 - -
Ceso2g03309 379 CDD RIBOc 58 207 IPR000999 GO:0004525(InterPro)|GO:0006396(InterPro)
Ceso2g03309 379 SMART riboneu5 58 208 IPR000999 GO:0004525(InterPro)|GO:0006396(InterPro)
Ceso2g03309 379 Pfam Ribonuclease III domain 76 185 IPR000999 GO:0004525(InterPro)|GO:0006396(InterPro)
Ceso2g03309 379 SUPERFAMILY dsRNA-binding domain-like 167 276 - -
Ceso2g03309 379 Hamap Ribonuclease 3 [rnc]. 46 271 IPR011907 GO:0003723(InterPro)|GO:0004525(InterPro)|GO:0006364(InterPro)
Ceso2g03309 379 ProSiteProfiles Ribonuclease III family domain profile. 43 185 IPR000999 GO:0004525(InterPro)|GO:0006396(InterPro)
Ceso2g03309 379 SMART DRBM-3 214 275 IPR014720 -
Ceso2g03309 379 SMART DRBM-3 294 374 IPR014720 -
Ceso2g03309 379 SUPERFAMILY dsRNA-binding domain-like 293 373 - -
Ceso2g03309 379 Pfam Double-stranded RNA binding motif 214 274 IPR014720 -
Ceso2g03309 379 SUPERFAMILY RNase III domain-like 42 205 IPR036389 GO:0004525(InterPro)|GO:0006396(InterPro)
Ceso2g03309 379 FunFam Endoribonuclease dicer-like 1 37 206 - -
Ceso2g03309 379 PANTHER DICER-RELATED 35 317 - GO:0003723(PANTHER)|GO:0004525(PANTHER)|GO:0005634(PANTHER)|GO:0005737(PANTHER)|GO:0030422(PANTHER)
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Ceso2g03309 - -
leaf

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 Duplicated-type
Ceso Ceso-Chr2:32716844 Ceso2g03309 Ceso-Chr2:82827603 dispersed
Ceso Ceso-Chr2:82827603 Ceso6g03185 Ceso-Chr6:80805652 dispersed
Ceso Ceso-Chr2:82827603 Ceso6g02287 Ceso-Chr6:60669444 transposed