Asteraceae Genomic Research Platform
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Chla9g03238 | ATGGAGTTGCAGAATCAAGTAGCACAGGCGGTGCACGTGCTGAACCACGATACGCAATCGTGTAACCGAGTATCAGCTAATCAGTGGTTAGTTGAGTTTCAACAAACAAATGCTGCTTGGGAGATTGCCACTTGTATATTGACGGCATCTGATAATAAGCAGTTTGTTTCCGATTTCGAAGTCGAATTCTTCGCTGCTCAGCTTCTTAAACGAAAGATCCAAAATGAGGGACATTGTCTCCAGCTGGAAGCAAAAGAATCTCTAGTTAATGCTCTCCTTTTGGCTGCTAAAAGATTTAGTTTAGGCCCATCCCAGCTCTTAACACAGATTTGTCTGGCTCTATGCATGCTCATACTTCATGCGGTGGAGTACTACAAACCAATAGAGAAGCTCTTTTACAGTCTTCAGACCCTGCAAGGTCAAGATGATGGCAATATCGTTGTTTTGGAAATGCTCACGGTCTTACCAGAGGTCGTTGAAGATGAATGTGCTAATTATAGAACCAAGTCCGGTCAAAGAATTGACTATGGCCCAGAGCTACTCTCACATACATCCGCAGTGCTAGAGTTCCTAAAGCAGCAATCCGAAGAAAGCTTTAATGGTGCCATTCAACTACATGAACGGAGCAGAAAGATACTGCGCTGTTTGTTAAGTTGGGTTCGAGCAGGATGTTTCTCGGAAATTTTGCCAGTTTCGTTATTAGCCCATCCGCTTCTTAATTTTGTTTTCAATTCTTTACAGGTTTCATCCTCATTTGATCTGGCAATTGAGGTTTTAATTGACCTTGTTGGCCGACATGAGGGTTTACCACAAGTTCTTCTCAGCAAAGTAGGATTTCTTAAAGACGTTCTTCTACGAGCATTCAATGGTGGAAATGAGAAAGTAATTAGTGGTCTTGCATGCTTGATGTCTGAGATTGGTCAGGCTGCTCCATATTTGATCATAGAAGCCCATTCGGAAGCACTTATACTGGTGGATGCACTTTTGAGCTGTGTATCATTTCCAAGTCAAGATTGGGAGATTGCAGACTCAACTTTGCAGTTCTGGTGTAGTCTTGCAAGCAATATTGTTCGAATGGATGATGAGAATACAGAGAATAGCAAACATGTCAAAGATGTTTTTTCACCAGTATTTTCAGCATTGCTTGATGCTCTTTTGATGCGTTCTCAGGTGGATGATTCAACATATACAAATGAGACTGCACCAAGGGACTTGCCAGATGGCCTTGCTCAGTTTAGGTTAAATCTAGTGGAGCTTATGGTGGACATTTGCCAGCTTCTAAAGTCTGCTGTGTTTTTGCAAAAGATTTTTTTTGGTGGTTGGCTGTCTTCAAACGCACAAATTCCTTGGAAGGAGGTGGAAACCAGAATGTCTGCTCTTAACGTGGTTGCTGATGTAGTACTGCATGAAGGTCAAACATTTGATCTCTCAATGGTCTTGCACTTGGTCACAGTTCTGTGTGATCATGCATCATATGAACCGAAAGGCTTTATGTGCATTGTACATAAATCACTTGCAGATGTTATTGGTTCATATTCGAAGTGGATGTCTTCTTACGTAACTAATGCCAGGCCATTGCTTTTATTTTTTGCAGCTGGTATGTCAGAGCCTTTATGCTCACATGCTTGTGCAACTGCCTTCAGGAAGATCTGTGAAGATGCTACCAAAGGATTGGAAAAGAGACAGTTACCTCTGGAAGACGAGGAAGATATTATTAGTGCTATTACGTTGATACTTGGAAGCCTTCCTAACTTGGAATTAAGAAACAATCTGTTGCTTAAGTTGCTTTCTCCTAGTTGTGGATCTATTGGGAAACTTCTTGATGGAGATCGTGTCCAGTCTTTGAGGCAACTACCAAGTGCTTATACTCATCTTGTCAACTCTGCAACGAGGGGTTTCTTCAGGATAGGAGCTGTATTCAGTCACCTTGTAATGGCACCCACTACATGTCATGATATAGACAATTCTATGATAGTCGTTCTTGAAAGTTTTTGGCCTCTGCTTGAAAAATTCTTTCAGTCAGAGCACATTGAGAATGCAAGTTTATCCGTGGCTGCATGCAGGGCTCTCTCACAAGCAATTAAGTCTGCAGGCCATCATTTTGTTACACTGTTGCCAAAAGTTTTGGATTACCTATCAACAAGTTTTGTTTCATTTCAAACTCATGAGTGCTACCTTAAAACAGCTTCTGTTGTCGTTGAAGAATTTGGTAATAAGGAGGAATATGGACCTCTATTTATCAGCACGCTTGAAAGATTTACAAATGCATCATCAGTGATGTCTCTAAATTCTTCATATGTGTGTGATCAAGAGCCCGATCTTGTTGAGGCATATTGCAGTTTTACATCAATATTTCTTCACAGTTCGTCAAAGGAAGTAGTAGCTTCTTCTGGTCCTCTTCTAGAAGTTTCCTTTCAGAAAGCAGCTATTTGTTGTACAGCTATGCATCGTGGAGCAGCACTTGCTGCAATGTCGTATATGTCTTGTTTTCTAGAGTTTTGCATGACTTCATTGCTGGAATCAGCCACTTGTAACTCTGAATTAAATGTTACATCAATGGCGGTTCATGTAATATCTCACAGTGGTGAGGGACTTGTATCAAATGTGGTATATGCTTTACTTGGTGTTTCTGCAATGTCAAGGGTTCATAAATCTGCAACAATATTGCAGCAGTTGGCAGCAGTATGCAGTTTTAGTGAGAAAACAAAGTGGAAGTCTATTCTTTGTTGGGATTCTTTGAATAATTGGCTACATGCTGCGGTACGGAGTCTACCTGGTGAGTACTTGAGACAGGGAGAAGCAGAATCTTTAGCACCGGTATGGCTAAAAGCCTTGGGTGATGCAGCAATTGATTATGTTGAAAGCAGAACGAGCCATGGAGAGAAGAATCATAAACATATGCGGGGAAAAGGTGGCAGGATGCTTAAGTATCTATTTCGTGAATTTGTTGATAGTCATCGTAATATTGTTACATGA | 2976 | 41.03 | MELQNQVAQAVHVLNHDTQSCNRVSANQWLVEFQQTNAAWEIATCILTASDNKQFVSDFEVEFFAAQLLKRKIQNEGHCLQLEAKESLVNALLLAAKRFSLGPSQLLTQICLALCMLILHAVEYYKPIEKLFYSLQTLQGQDDGNIVVLEMLTVLPEVVEDECANYRTKSGQRIDYGPELLSHTSAVLEFLKQQSEESFNGAIQLHERSRKILRCLLSWVRAGCFSEILPVSLLAHPLLNFVFNSLQVSSSFDLAIEVLIDLVGRHEGLPQVLLSKVGFLKDVLLRAFNGGNEKVISGLACLMSEIGQAAPYLIIEAHSEALILVDALLSCVSFPSQDWEIADSTLQFWCSLASNIVRMDDENTENSKHVKDVFSPVFSALLDALLMRSQVDDSTYTNETAPRDLPDGLAQFRLNLVELMVDICQLLKSAVFLQKIFFGGWLSSNAQIPWKEVETRMSALNVVADVVLHEGQTFDLSMVLHLVTVLCDHASYEPKGFMCIVHKSLADVIGSYSKWMSSYVTNARPLLLFFAAGMSEPLCSHACATAFRKICEDATKGLEKRQLPLEDEEDIISAITLILGSLPNLELRNNLLLKLLSPSCGSIGKLLDGDRVQSLRQLPSAYTHLVNSATRGFFRIGAVFSHLVMAPTTCHDIDNSMIVVLESFWPLLEKFFQSEHIENASLSVAACRALSQAIKSAGHHFVTLLPKVLDYLSTSFVSFQTHECYLKTASVVVEEFGNKEEYGPLFISTLERFTNASSVMSLNSSYVCDQEPDLVEAYCSFTSIFLHSSSKEVVASSGPLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYMSCFLEFCMTSLLESATCNSELNVTSMAVHVISHSGEGLVSNVVYALLGVSAMSRVHKSATILQQLAAVCSFSEKTKWKSILCWDSLNNWLHAAVRSLPGEYLRQGEAESLAPVWLKALGDAAIDYVESRTSHGEKNHKHMRGKGGRMLKYLFREFVDSHRNIVT | 991 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chla9g03238 | 991 | Pfam | Exportin 1-like protein | 104 | 259 | IPR013598 | - | |
| Chla9g03238 | 991 | PANTHER | TRANSPORTIN 3 AND IMPORTIN 13 | 5 | 987 | IPR051345 | GO:0005737(PANTHER)|GO:0006606(PANTHER) | |
| Chla9g03238 | 991 | SUPERFAMILY | ARM repeat | 1 | 835 | IPR016024 | - | |
| Chla9g03238 | 991 | Gene3D | - | 2 | 940 | IPR011989 | - |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Chla9g03238 | K15436 | transportin-3 |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|
| Chla | Chla-Chr7:13438633 | Chla9g03238 | Chla-Chr9:111411038 | dispersed | |
| Chla | Chla-Chr9:38865649 | Chla9g03238 | Chla-Chr9:111411038 | dispersed |