Asteraceae Genomic Research Platform
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Chmo26g01667 | ATGGAGTTGCAGAGTCAAGTAGCACAGGCGGTGCACGTGCTGAACCACGATACGCAATCGTGTAACCGAGTATCAGCTAATCAATGGTTAGTTGAGTTTCAACAAACAAATGCTGCTTGGGAGATTGCTACTTGTATATTGACGTCATCTGATAATAAGCAGTTTGTTTCCGATTTCGAAGTTGAATTCTTCGCTGCTCAGCTTCTTAAACGAAAGATCCAAAATGAAGGACATTGTCTCCAGCTGGAAGCAAAAGAATCTCTTGTTAATGCTCTCCTTTTGGCTGCTAAAAGATTTAGTTTAGGCCCATCCCAGCTCTTAACACAGATTTGTCTGGCTCTATGCATGCTCATACTTCATGCGGTGGAGTACTACAAACCAATAGAGAAGCTCTTTTACAGTCTTCAGACCCTGCAAGGTCAAGATGATGGCAGTATCGTTGTTTTGGAAATGCTCACGGTCTTGCCAGAAGTCGTTGAAGATGAATGTGCTAATTATAGAACCAAGTCCGGTCAAAGAATTGACTATGGCCCAGAGCTACTCTCACATACATCCGCAGTGCTAGAGTTCCTAAAGCAGCAATCCGAAGAAAGCTTTAATGGTGCCATTCAACTACATGAACGGAGCAGAAAGATACTGCGCTGTTTGTTAAGTTGGGTTCGAGCAGGATGTTTCTCGGAAATTTTGCCAGTTTCGTTATTAGCCCATCCGCTTCTTAATTTTGTTTTCAATTCTTTGCAGGTTTCATCCTCATTTGATCTGGCAATTGAGGTTTTAATTGAGCTCGTTGGCCGACATGAGGGTTTACCACAAGTTCTTCTCAGCAAAGTAGGATTTCTTAAAGACGTTCTTCTTCGAGCATTCAATAGTGGAAATGAAAAAGTAATTAGCGGTCTTGCATGCTTGATGTCTGAGATTGGTCAGGCTGCTCCATATTTGATCATAGAAGCCCATTCAGAAGCACTTATACTGGTGGATGCACTTTTGAGCTGTGTATCATTTCCAAGTCAAGATTGGGAGATTGCAGACTCAACTTTGCAGTTCTGGTGTAGTCTTGCAAGCAATATTGTCCGAATGGATGATGAGAATACAGAGAATAGCAAACATGTCAAAGATGTTTTTTCACCAGTATTTTCAGCATTGCTTGATGCTCTTTTGATGCGTTCTCAGGTGGATGATTCAACATATACAAATGAGACTGCACCAAGGGACTTGCCAGATGGCCTTGCTCAGTTTAGGTTAAATCTAGTGGAGCTTATGGTGGACATTTGCCAGCTTTTAAAGTCTGCTGTGTTTTTGCAAAAGATTTTTTTTGGTGGTTGGTTGTCTTCAAATGTACAAATTCCTTGGAAGGAGGTGGAAACCAGAATGTCTGCTCTTAACGTGGTTGCTGATGTAGTACTGCATGAAGGTCAAACATTTGATCTCTCAATGGTCTTGCACTTGGTCACAGTTTTGTGTGATCATGCATCATATGAACCGAAAGGCTTTATGTGCATTGTACATAAATCACTTGCAGACGTTATTGGTTCGTATTCGAAGTGGATGTCTTCTTACGTAACTAATGCCAGGCCATTGCTTTTATTTTTTGCAGCTGGTATGTCAGAGCCTTTATGCTCACATGCTTGTGCAACTGCCTTCAGGAAGATCTGTGAAGATGCTACCGAAGTTATGCACGAACCTTCAAGTTTAGAAATGCTAATGTGGATTGGAGAGGGATTGGAAAAGAGACAGTTACCTCTGGAAGACGAGGAAGATATTATTAGTGCTATTACTTTGATACTTGGAAGCCTTGCGAACTTGGAATTAAGAAACAATCTGTTGCTTAAGTTGCTTTCTCCTAGTTGTGGATCTATCGGGAAACTTCTTGATGGAGATCATGTCCAGTCTTTGAGGCAACTACCAAGTGCTTATACTCATCTTGTCAACTCTGCAACGAGGGGTTTCTTCAGGATAGGAGCTGTATTCAGTCATCTTGTAATGGCACCCACTACATGTCATGATATAGACAATTCTATGATAGTCGTTCTTGAAAGTTTTTGGCCTCTGCTTGAAAAATTCTTTCAGTCAGAGCACATTGAGAATGCAAGTTTATCCGTGGCTGCATGCAGGGCTCTCTCACAAGCAATTAAGTCTGCAGGCCATCATTTTGTTACACTGTTGCCAAAAGTTTTGGATTACCTATCAACAAGTTTTGTTTCATTTCAAACTCATGAGTGCTACCTTAAAACAGCTTCTGTTGTGGTTGAAGAATTTGGTAATAAGGAGGAATATGGACCTCTATTTATCAGCACGCTTGAAAGATTTACAAATGCATCATCAGTAATGTCTCTAAATTCTTCATATGTGTGTGATCAAGAGCCCGATCTTGTTGAGGCATATTGCAGTTTTACATCAATATTTCTTCACAGTTCGTCAAAGGAAGTAGTAGCTTCTTCTGGTCCTCTTCTAGAAGTTTCCTTTCAGAAAGCAGCTATTTGTTGTACAGCTATGCATCGTGGAGCAGCACTTGCTGCAATGTCGTATATGTCTTGTTTTCTAGAGTTTTGCATGACTTCATTGCTGGAATCAGCCACTTGTAACTCTGAATTAAATGTTACATCAATGGCGGTTCATGTAATATCTCACAGTGGTGAGGGACTTGTATCAAATGTGGTATATGCTTTACTTGGTGTTTCGGCAATGTCAAGGGTTCATAAATCTGCAACAATATTGCAGCAGTTGGCAGCAGTATGCAGTTTTAGTGAGAAAACAACGTGGAAGTCTATTCTTTGTTGGGATTCTTTGAATAATTGGCTACATGCTGCGGTACGGAGTCTACCTGGTGAGTACTTGAGACAGGGAGAAGCCGAATCTTTAGCACCGGTATGGCTAAAAGCCTTGGGTGATGCAGCAATTGATTATGTTGAAAGCAGAACGAGCCATGGAGAGAAGAATCATAAACATATGCGGGGAAAAGGTGGCAGGATGCTTAAGTATCTATTTCGTGAATTCGTTGATAGTCATCGTAACATTGTTACATGA | 3024 | 40.97 | MELQSQVAQAVHVLNHDTQSCNRVSANQWLVEFQQTNAAWEIATCILTSSDNKQFVSDFEVEFFAAQLLKRKIQNEGHCLQLEAKESLVNALLLAAKRFSLGPSQLLTQICLALCMLILHAVEYYKPIEKLFYSLQTLQGQDDGSIVVLEMLTVLPEVVEDECANYRTKSGQRIDYGPELLSHTSAVLEFLKQQSEESFNGAIQLHERSRKILRCLLSWVRAGCFSEILPVSLLAHPLLNFVFNSLQVSSSFDLAIEVLIELVGRHEGLPQVLLSKVGFLKDVLLRAFNSGNEKVISGLACLMSEIGQAAPYLIIEAHSEALILVDALLSCVSFPSQDWEIADSTLQFWCSLASNIVRMDDENTENSKHVKDVFSPVFSALLDALLMRSQVDDSTYTNETAPRDLPDGLAQFRLNLVELMVDICQLLKSAVFLQKIFFGGWLSSNVQIPWKEVETRMSALNVVADVVLHEGQTFDLSMVLHLVTVLCDHASYEPKGFMCIVHKSLADVIGSYSKWMSSYVTNARPLLLFFAAGMSEPLCSHACATAFRKICEDATEVMHEPSSLEMLMWIGEGLEKRQLPLEDEEDIISAITLILGSLANLELRNNLLLKLLSPSCGSIGKLLDGDHVQSLRQLPSAYTHLVNSATRGFFRIGAVFSHLVMAPTTCHDIDNSMIVVLESFWPLLEKFFQSEHIENASLSVAACRALSQAIKSAGHHFVTLLPKVLDYLSTSFVSFQTHECYLKTASVVVEEFGNKEEYGPLFISTLERFTNASSVMSLNSSYVCDQEPDLVEAYCSFTSIFLHSSSKEVVASSGPLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYMSCFLEFCMTSLLESATCNSELNVTSMAVHVISHSGEGLVSNVVYALLGVSAMSRVHKSATILQQLAAVCSFSEKTTWKSILCWDSLNNWLHAAVRSLPGEYLRQGEAESLAPVWLKALGDAAIDYVESRTSHGEKNHKHMRGKGGRMLKYLFREFVDSHRNIVT | 1007 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chmo26g01667 | 1007 | Gene3D | - | 2 | 956 | IPR011989 | - | |
| Chmo26g01667 | 1007 | PANTHER | TRANSPORTIN 3 AND IMPORTIN 13 | 5 | 1003 | IPR051345 | GO:0005737(PANTHER)|GO:0006606(PANTHER) | |
| Chmo26g01667 | 1007 | Pfam | Exportin 1-like protein | 104 | 259 | IPR013598 | - | |
| Chmo26g01667 | 1007 | SUPERFAMILY | ARM repeat | 1 | 851 | IPR016024 | - |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Chmo26g01667 | K15436 | transportin-3 |
| Select | Gene_1 | Gene_2 | Event_name |
|---|---|---|---|
| 221580 | Chmo25g01542 | Chmo26g01667 |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|
| Chmo | Chmo-Chr6:15252210 | Chmo26g01667 | Chmo-Chr26:137073910 | transposed | |
| Chmo | Chmo-Chr25:128207562 | Chmo26g01667 | Chmo-Chr26:137073910 | wgd |