Asteraceae Genomic Research Platform
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Chna2g00833 | ATGGAGTCGATAATAGCTCGAGCGTTGGAGTACACATTGAAATACTGGCTTAAATCATTTACTAGAGATCAGTTTAAGCTACAAGGCAGAACTGTTCAGCTCTATAATCTAGATATAAATGGTGATGCCTTGCACGCGAGCCTCGGGTTGCCTCCGGCATTGAATGTTAAAACTGCGAAAGTCGGCAAGCTAGAGATAATACTCCCTTATTTGAGCAACGTACAAGTGGAGCCAATTGTTGTGCAAATCGATAAGCTTGATCTGGTGTTGGAGGAAAATGACGATTTGGATGCATATAAAAGTACAGAGAGTGCACAAACGCCATCCAGTCCAGCAAAAGGCAGTGGATATGGATTTGCGGACAAGATTGCAGATGGCATGACATTGGAAGTACGGACTGTCAATCTTTTAGTTGAGACTCATGGGGGTGCTAGACGTCGTGGAGGAGCAACTTGGGCATCACCGATGGCATCTATTACTATCCGCAACCTTTTGCTTTATACCACAAATGAGAACTGGCAGGTTGTAAATCTTAAGGAAGCGAGGGACTTTTCAAATGACAAGAAGTTCATCTATGTTTTCAAAAAGCTTGAATGGGAACATCTATCCATCGACCTCCTGCCTCACCCTGATATGTTTGCAGCATTTTCCGAGGGTGCATTTAAGGATGACGATGGTGCAAAGCGGGTGTTCTTTGGTGGGGAGCGCTTTCTTGAAGGGATATCTGGGGAAGCTTATATTACTATTCAAAGGACAGAGCTTAATAGTCCACTAGGGTTGGAACTCCAGTTACATATTACTGAAGCCGTGTGCCCAGCTTTGAGTGAACCAGGATTAAGGGCTCTTCTTCGCTTCTTTACTGGATTTTATGTCTGTCTGAATAGAGGCGATGTCAATCCAAATGCTCAAGAGCGATCAGCAGAAGCTGCAGGGCGCACACTAGTCTCCATTATGGTGGACCATATATTCTTTTGCATCAAGGATACTGATTTCCAGTTAGAACTTATGATGCAGTCACTTCTCTTTTCTCGGGCAAGTCTTTCTGATGGAGAAATCGCCAAATGCTTGACACGGGTGATGATAGGTGGAGTATTTCTGCGGGATACTTCCTCTCGCCCACCATGCGCGTTAGTGCAACCATCAATGCAGGATGCCACAGAGGAACCGCTGAAGATTCCAGATTTTGGAAAAGATTTCTGTCCTCCAATATATCCATTAGGGGATCAGCAATGGAAATTGAGTGACCGCATACATCTTCAAGAAGATTCCTGTCTAAGAATATCATCTTTACTAGCTGATGGAATTGTGGTTAATCATGGTGATATTTTACCAGATTATACTGTCAACTCCCTTGAATTGAAAGTCAAAGGTTTAGATATCACTGTTCCAATGGAATATCAGAACGAGAGCTCCTTCACTGGAGCAAGACTTCATATTGAGAACCTATTCTTTCATGACTCCCCTTCCCTGAGGCTCAAGCTGCTCAATCTTGACAAAGATCCCGCATGCTTCTGTTTATGGAAAGGACAACCCATTGACGCCAGCCAAAAAAAATGGACAAGTGGAGCTTCTCTTATTAATATGTCTCTAGAAACATGTAATAATTCAAAAGGAGTTAATGGGCCCCGTTCACACTCTTCGGAATTATGGAAATCTGTTGAGATAAAAGGTGTTTGTGTTCAAGTAGCAATGGTAACAGCAGATGGAAGCCCGTTAATAGAAATCCCACCTCCAGGAGGAGTTGTTAGGGTAGGAGTCGCTTGTGAACAATATCTGTCCAACACTTCCGTGGAGCAACTATTTTTTGTTTTGGATCTTTATACGTATTTTGGTACGGTTAGCGAGAAAATGGCATTGGTTGGAAAAAATAAACATAAGAAGGTGGTGAAGCGTGAGCTCTCTAATGGAAACCTGATAGAAAAGGTTCCTGGTGATACTGCTGTTAGTTTAGTAGTTAAGGACCTAAAGCTAACATTTCTAGAATCTTCCTCCATGGATATTCAGGGAATGCCTTTAGTTCAGTTTGTTGGGGAAGATCTGTTCATGGAAGTTACTCATAGAACCTTGGGTGGTGCCATGGCCATTTCGTCAACTTTAAAGTGGGACAGAGTTCAGGTGGAGTGTGCAGAAACTGAGATAAGCTCGGTACATACGAATGGTGTAGTTGTGAATGCTACCGAAGATTTTGTTCCTGTTCAAAATGGCTACCCAAAACTGAGAGCTGTCTTTTGGGTGCAAAATGGAAGTAACTTACCATTTGTGAATTTACGTATGGTGCATGTTATTCCGTATAATGCACAGGATACAGAGTGTCATAGTTTAAGTGTTTCGGCTTGTATTGCTGGTGTGCGCCTTGCAGGAGGAATGAGTTACGCTGAAGCTCTTCTTCACCGATTTGGAATTTTAGGACCAGATGGTGGGCCAGGGGTTGGGCTCTCCAAGGGTTTGGACCATTTATCTGCGGGCCCATTGTCGAAACTTTTCAAACGATCACCTCTGCTTGTAGAGACCGTCAGGGAGAGTAAAAGTGAAAGCGTAGAGGAGGAGAATCATATTGGTAACTTGCATTTGGGTGCGCCAGATGATGTAGATATATCACTAGAATTGAAGGACTGGTTATTTGCACTGGAGGGTGCAGATATGGCAGAAAAATGGTGGTTATATAGTTCAGAGGATTCTTACAGAGAAGAGAGGTGCTGGCACACAACCTTTGACAGTATAAAAGCTAAGGCAAACAGCAGCAAAAAGTCCTTAGTGAATGGAAAAAAGAATTTTCCTGGCTCAAAGAAGTATCCTGTCGAATCAATTACGGTTGGTATTGAAGGCTTAAAGACGCTAAAACCCCAGCAGCAGAAGGGAACTGCACCTCAGAACGGGCACAAGCAAATTGTTGAGTCACATGGTGGTGTCGATTTTGAAGCTGATATAGTCTTGAATGAAGATGATGATGTCGATGGGATGATCAAATGGGTTGAGGCATTTGTAACCAAGGATGAACTGCAACATGTTGCTCAACTATGCAAGTCAGAAGTTGATTCCATGGGACGAATAACTGCAGGATTTTTACGTGTGTTGAAGTTAGAAGGATCAGTTGGTCAGTCAGCAATGAATCAACTAAGCAACCTTGGAAGTGAAGGGTTTGACAAGATCTTCTCGCCAGAGAACCCGCGCAGAGATAGTACTGCTTCTAGTGTCGGTATGAGTCCGTTTTCCCTAGTGGCTTCAGATAACCAACATTCTTCGTCCTTCAATTCAACATTAAATTCACTCGAGGCTGCATTATTAGAATCACAGACAGATTGTGCAGCTCTTGTCACTGAACTAAGCAGTTCGGAATCTCCCAAGCCACACCTTCATAGTGTAGAACAACTTGCCCAGAAACTTGAGAGTATGCAGAAATTGTTATTAAAGTTGCAGACTGAGGTATAA | 3429 | 42.99 | MESIIARALEYTLKYWLKSFTRDQFKLQGRTVQLYNLDINGDALHASLGLPPALNVKTAKVGKLEIILPYLSNVQVEPIVVQIDKLDLVLEENDDLDAYKSTESAQTPSSPAKGSGYGFADKIADGMTLEVRTVNLLVETHGGARRRGGATWASPMASITIRNLLLYTTNENWQVVNLKEARDFSNDKKFIYVFKKLEWEHLSIDLLPHPDMFAAFSEGAFKDDDGAKRVFFGGERFLEGISGEAYITIQRTELNSPLGLELQLHITEAVCPALSEPGLRALLRFFTGFYVCLNRGDVNPNAQERSAEAAGRTLVSIMVDHIFFCIKDTDFQLELMMQSLLFSRASLSDGEIAKCLTRVMIGGVFLRDTSSRPPCALVQPSMQDATEEPLKIPDFGKDFCPPIYPLGDQQWKLSDRIHLQEDSCLRISSLLADGIVVNHGDILPDYTVNSLELKVKGLDITVPMEYQNESSFTGARLHIENLFFHDSPSLRLKLLNLDKDPACFCLWKGQPIDASQKKWTSGASLINMSLETCNNSKGVNGPRSHSSELWKSVEIKGVCVQVAMVTADGSPLIEIPPPGGVVRVGVACEQYLSNTSVEQLFFVLDLYTYFGTVSEKMALVGKNKHKKVVKRELSNGNLIEKVPGDTAVSLVVKDLKLTFLESSSMDIQGMPLVQFVGEDLFMEVTHRTLGGAMAISSTLKWDRVQVECAETEISSVHTNGVVVNATEDFVPVQNGYPKLRAVFWVQNGSNLPFVNLRMVHVIPYNAQDTECHSLSVSACIAGVRLAGGMSYAEALLHRFGILGPDGGPGVGLSKGLDHLSAGPLSKLFKRSPLLVETVRESKSESVEEENHIGNLHLGAPDDVDISLELKDWLFALEGADMAEKWWLYSSEDSYREERCWHTTFDSIKAKANSSKKSLVNGKKNFPGSKKYPVESITVGIEGLKTLKPQQQKGTAPQNGHKQIVESHGGVDFEADIVLNEDDDVDGMIKWVEAFVTKDELQHVAQLCKSEVDSMGRITAGFLRVLKLEGSVGQSAMNQLSNLGSEGFDKIFSPENPRRDSTASSVGMSPFSLVASDNQHSSSFNSTLNSLEAALLESQTDCAALVTELSSSESPKPHLHSVEQLAQKLESMQKLLLKLQTEV | 1142 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Chna2g00833 | 1142 | PANTHER | UNCHARACTERIZED | 1 | 416 | IPR026728 | - | |
| Chna2g00833 | 1142 | Coils | Coil | 1121 | 1141 | - | - | |
| Chna2g00833 | 1142 | Pfam | VPS13-like, N-terminal | 1 | 104 | IPR026854 | - |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Chna2g00833 | - | - |
| Select | Gene_1 | Gene_2 | Event_name |
|---|---|---|---|
| 58650 | Chna2g00833 | Chna6g03789 |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | E-value | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1621766 | Chna | Chna2g00614 | Chna-Chr2:44791601 | Chna2g00833 | Chna-Chr2:64326324 | |
| 1632355 | Chna | Chna2g00833 | Chna-Chr2:64326324 | Chna6g03789 | Chna-Chr6:324868248 |