Asteraceae Genomic Research Platform
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Cind9g03628 | ATGGAGTTGCAGAATCAAGTAGCACAGGCGGTGCACGTGCTGAACCACGATACGCAATCGTGTAACCGAGTATCAGCTAATCAGTGGTTAGTTGAGTTTCAACAAACAAATGCTGCTTGGGAGATTGCCACTTGTATATTGACGGCATCTGATAATAAGCAGTTTGTTTCCGATTTCGAAGTCGAATTCTTCGCTGCTCAGCTTCTTAAACGAAAGATCCAAAACGAGGGACATTGTCTCCAGCTGGAAGCAAAAGAATCTCTAGTTAATGCTCTCCTTTTGGCTGCTAAAAGATTTAGTTTAGGCCCATCCCAGCTCTTAACACAGATTTGTCTGGCTCTATGCATGCTCATACTTCATGCGGTGGAGTACTACAAACCGATAGAGAAGCTCTTTTACAGTCTTCAGACCCTGCAAGGTCAAGATGATGGCAATATCGTTGTTTTGGAAATGCTCACGGTCTTACCAGAAGTCGTTGAAGATGAATGTGCTAATTATAGAACCAAATCCGGTCAAAGAATTGACTATGGCCCAGAGCTACTCTCACATACATCCGCAGTGCTAGAGTTCCTAAAGCAGCAATCCGAAGAAAGCTTTAATGGTGCCATTCAACTACATGAACGGAGCAGAAAGATACTGCGCTGTTTGTTAAGTTGGGTTCGAGCAGGATGTTTCTCGGAAATTTTGCCAGTTTCGTTATTAGCCCATCCGCTTCTTAATTTTGTTTTCAATTCTTTACAGGTTTCGTCCTCATTTGATCTGGCAATTGAGGTTTTAATTGACCTCGTTGGCCGACATGAGGGTTTACCACAAGTTCTTCTCAGCAAAGTAGGATTTCTTAAAGACGTTCTTCTACGAGCATTCAATGGTGGAAATGAGAAAGTAATTAGTGGTCTTGCATGCTTGATGTCTGAGATTGGTCAGGCTGCTCCATATTTGATCATAGAAGCCCATTCGGAAGCACTTATACTGGTGGATGCACTTTTGAGCTGTGTATCATTTCCAAGTCAAGATTGGGAGATTGCAGACTCAACTTTGCAGTTCTGGTGTAGTCTTGCAAGCAATATTGTTCGAATGGATGATGAGAATACAGAGAATAGCAAACATGTCAAAGATGTTTTTTCACCAGTATTTTCAGCATTGCTTGATGCTCTTTTGATGCGTTCTCAGGTGGATGATTCAACATATACAAATGAGACTGCACCAAGGGACTTGCCAGATGGCCTTGCTCAGTTTAGGTTAAATCTAGTGGAGCTTATGGTGGACATTTGCCAGCTTCTAAAGTCTGCTGTGTTTTTGCAAAAGATTTTTTTTGGTGGTTGGCTGTCTTCAAACGCACAAATTCCTTGGAAGGAGGTGGAAACCAGAATGTCTGCTCTTAACGTGGTTGCTGATGTAGTACTGCATGAAGGTCAAACATTTGATCTCTCAATGGTCTTGCACTTGGTCACAGTTCTGTGTGATCATGCATCATATGAACCGAAAGGCTTTATGTGCATTGTACATAAATCACTTGCAGATGTTATTGGTTCATATTCGAAGTGGATGTCTTCTTACGTAACTAATGCCAGGCCATTGCTTTTATTTTTTGCAGCTGGTATGTCAGAGCCTTTATGCTCACATGCTTGTGCAACTGCCTTCAGGAAGATCTGTGAAGATGCTACCGTTATGCACGAACCTTCAAGTTTAGAAATGCTAATGTGGATTGGAGAGGGATTGGAAAAGAGACAGTTACCTCTGGAAGACGAGGAAGATATTATTAGTGCTATTACGTTGATACTTGGAAGCCTTCCTAACTTGGAATTAAGAAACAATCTGTTGCTTAAGTTGCTTTCTCCTAGTTGTGGATCTATTGGGAAACTTCTTGATGGAGATCGTGTCCAGTCTTTGAGGCAACTACCAAGTGCTTATACTCATCTTGTCAACTCTGCAACGAGGGGTTTCTTCAGGATAGGAGTTGTATTCAGTCATCTTGTAATGGCACCCACTACATGTCATGATATAGACAATTCTATGATAGTCGTTCTTGAAAGTTTTTGGCCTATGCTTGAAAAATTCTTTCAGTCAGAGCACATTGAGAATGCAAGTTTATCTGTGGCTGCATCCAGGGCTCTCTCACAAGCAATTAAGTCTGCAGGCCATCATTTTGTTACACTGTTGCCAAAAGTTTTGGATTACCTATCAACAAGTTTTGTTTCATTTCAAACTCATGAGTGCTACCTTAAAACAGCTTCTGTTGTCGTTGAAGAATTTGGTAATAAGGAGGAATATGGACCTCTATTTATCAGCACGCTTGAAAGATTTACAAATGCATCATCAGTGATGTCTCTAAATTCTTCATATGTGTGTGATCAAGAGCCCGATCTTGTTGAGGCATATTGCAGTTTTACATCAATATTTCTTCACAGTTCGTCAAAGGAAGTAGTAGCTTCTTCTGGTCCTCTTCTAGAAGTTTCCTTTCAGAAAGCAGCTATTTGTTGTACAGCTATGCATCGTGGAGCAGCACTTGCTGCAATGTCGTATATGTCTTGTTTTCTAGAGTTTTGCATGACTTCATTGCTGGAATCAGCCACTTGTAACTCTGAATTAAATGTTACATCAATGGCGGTTCATGTAATATCTCACAGTGGTGAGGGACTTGTATCAAATGTGGTATATGCTTTACTTGGCGTTTCTGCAATGTCAAGGGTTCATAAATCTGCAACAATATTGCAGCAGTTGGCAGCAGTATGCAGTTTTAGTGAGAAAACAACGTGGAAGTCTATTCTTTGTTGGGATTCTTTGAATAATTGGCTACATGCTGCGGTACGGAGTCTACCTGGTGAGTACTTGAGACAGGGAGAAGCAGAATCTTTAGCACCGGTATGGCTAAAAGCCTTGGGTGATGCAGCAATTGATTATGTTGAAAGCAGAACGAGCCATGGAGAGAAGAATCATAAACATATGCGGGGAAAAGGTGGCAGGATGCTTAAGTATCTATTTCGTGAATTCGTTGATAGTCATCGTAACATTGTTACATGA | 3021 | 41.11 | MELQNQVAQAVHVLNHDTQSCNRVSANQWLVEFQQTNAAWEIATCILTASDNKQFVSDFEVEFFAAQLLKRKIQNEGHCLQLEAKESLVNALLLAAKRFSLGPSQLLTQICLALCMLILHAVEYYKPIEKLFYSLQTLQGQDDGNIVVLEMLTVLPEVVEDECANYRTKSGQRIDYGPELLSHTSAVLEFLKQQSEESFNGAIQLHERSRKILRCLLSWVRAGCFSEILPVSLLAHPLLNFVFNSLQVSSSFDLAIEVLIDLVGRHEGLPQVLLSKVGFLKDVLLRAFNGGNEKVISGLACLMSEIGQAAPYLIIEAHSEALILVDALLSCVSFPSQDWEIADSTLQFWCSLASNIVRMDDENTENSKHVKDVFSPVFSALLDALLMRSQVDDSTYTNETAPRDLPDGLAQFRLNLVELMVDICQLLKSAVFLQKIFFGGWLSSNAQIPWKEVETRMSALNVVADVVLHEGQTFDLSMVLHLVTVLCDHASYEPKGFMCIVHKSLADVIGSYSKWMSSYVTNARPLLLFFAAGMSEPLCSHACATAFRKICEDATVMHEPSSLEMLMWIGEGLEKRQLPLEDEEDIISAITLILGSLPNLELRNNLLLKLLSPSCGSIGKLLDGDRVQSLRQLPSAYTHLVNSATRGFFRIGVVFSHLVMAPTTCHDIDNSMIVVLESFWPMLEKFFQSEHIENASLSVAASRALSQAIKSAGHHFVTLLPKVLDYLSTSFVSFQTHECYLKTASVVVEEFGNKEEYGPLFISTLERFTNASSVMSLNSSYVCDQEPDLVEAYCSFTSIFLHSSSKEVVASSGPLLEVSFQKAAICCTAMHRGAALAAMSYMSCFLEFCMTSLLESATCNSELNVTSMAVHVISHSGEGLVSNVVYALLGVSAMSRVHKSATILQQLAAVCSFSEKTTWKSILCWDSLNNWLHAAVRSLPGEYLRQGEAESLAPVWLKALGDAAIDYVESRTSHGEKNHKHMRGKGGRMLKYLFREFVDSHRNIVT | 1006 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cind9g03628 | 1006 | Gene3D | - | 2 | 955 | IPR011989 | - | |
| Cind9g03628 | 1006 | PANTHER | TRANSPORTIN 3 AND IMPORTIN 13 | 5 | 1002 | IPR051345 | GO:0005737(PANTHER)|GO:0006606(PANTHER) | |
| Cind9g03628 | 1006 | SUPERFAMILY | ARM repeat | 1 | 850 | IPR016024 | - | |
| Cind9g03628 | 1006 | Pfam | Exportin 1-like protein | 104 | 259 | IPR013598 | - |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Cind9g03628 | K15436 | transportin-3 |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|
| Cind | Cind-Chr4:59893618 | Cind9g03628 | Cind-Chr9:154456896 | dispersed | |
| Cind | Cind-Chr9:154456896 | Cind6g03078 | Cind-Chr6:17567618 | transposed |