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Gene details

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Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cobi4g02817 ATGGAGTTTAAACCACGTGATTACAGAGCTCAAGAAGAAGCCTATTCACTCAATCGAGTCTCAGTATCCTCACATCCTCTATGCTCGTCTTCAGTTTCATCAAATACGCAGGATAATGTGAGCATCGAATTCTTTGATCCCTTAAGGGGTCTATCAACAGAAATGCCTGAGACTGTTGAAGATACAGTTTTTGCAGAAAAACATTCTGCTAGTCAAACAGCCTCTCATCTATCAGCAAAGGAATGGACTTTGTTTAATAGGTTATTAATGCAGAAATTTCCAGTGCCAAAAATGATTTCAGTTTCTGCCTTTTCAAGCAAAACTATAAGAGGCAAGAAGGCAATTGGAGAATCACCTTTAAATACACAGTCAGATGAACTAAATGATTCTGAAAAGTTGTCTGAAAAAGGGTTTAAGACTGTAAGCCAACAGGAGTATGTAAAGCGGTTGCATGAACTTAAAGATGAGATCACACGCTCTTGGCGTTCTGGTGATCGTGTATCATCTTTAAAGTTATCAATTAAGGTTGCTAGGCTTCTGATGGACACGTGTGTGGCACAATTTTATCCAACTTTATTTGTTCTAGCTACTGATATAATGGACATGTTAGGTGATATGGTATGGGACAGAATTAGGGAGAAAGCTGAGTTTGCAGACGATGGGACCAGGATTTGCACTTTATCAGATGACTTTCAAGCAAATAATATATGCCTTGAAGCCAAAGAAACATGCAATAACTGGTTCAGAAAAATTGCCTCCATTCACGAGCTTCTTCCACGCATCTATCTTGAGCTTGCTATATTACCATGCTGGCGGTTTCTGCGTGATGATGTCACGGATGACATCATGCGTTTGGTTATGATGATAAGAGGAATTGCAGATCCATTGGCATCTGCTTACTGTCGCTTCTTTTTGATTCACTGTGCCCAAAAACTTCCCAAACGAGACACAGGGCATCTAGTAACCTGCATCAGTGATCAAAAAATTATACTGAAGCAAATTGTATCTACAAAAGTAACCAAGTACGGGAACTTTTTAGGAGATCACAAGTTGCTTATTAGCTTGATGGAACCAACAATTGAGTATACTGTGAGATGCATTTTTAAGGATCCAAATAAGGTTGATGATATGATTGTAAGACTTGAATTAGGGAAAAGCCCATTAAAGTTAAATGGGAAAGTTCCTTTGATATCAATAATCCTGCATTATTTACTCAAGGAGCTTCCAGTTGAAATAGTTTGTTCTAATGCTTTAGAAATTCTTCACCTTGTTGACTGCAGTAATGATTTTTCGTTTGACCAGTGTTTAAATTATAAGACGCTTGGGTTGAAGCTTTGTGAGGGAATTGATCAAGTGAACACGGTTGATGCAGTAATCGATGAAGTAATTCAGGCTGCTACTAAAAGGAAGATCCTTGATGAGTACTTGAAGATATTGGATGCTTATATGGATATTATTCTGTATTATAAGATGGATCAATCTCTAAGTTTCATTTTAAGTGAAATATTTGAAAGATTGTGCAATGAAGTGGTTACTGAAGATGAAATGGCTAGCCTGCAATCAATCGTTGTGAAGCTGGTCACACATTTTGATGATATGAAATATGTTTTTGATCTGAATTATTTTGTTGACATATTAGATGTCATGCATGGGAGTTCAAGAAGCCTTGTATGTATGCACATCCTCACTAATGCCACAAGAAAGGATCGCATTGATGATTCAACCACTATAAAACTGCTTTTTGATGTTGCTCAGTCTCTGCACGATAATGTGGACTTTTCAAACACGAGACAGGATGATAATCAACAGGCAGAGCGTTTGGTTGCTCGTTTTGTTGATAAGGTTGACCATGGTATGGAGTTGGACCGCCATTTGACATTTTTGGTTGAGTGTCGTGGAGCTTTTGGTAGCATGAATGATTTGATGGAGATTCTTGTTCATTCAAGCAATCTTTTAGCTACCAGAGCTTTGAAAGAGAAAAAAAATAATCTCAATTTTATCAAATCTTGCATCACTTTTAATGAAGTTACAATACCATGTATCCCATCTTATTCCAGGCAGTTAATCTTATACCTTGAAACCGCAGAGGTTTCTCTATCTGGAGGCTTGATTTCTCATTCAGATGGACTTTTAGATTCTGCAGTCTGCTGCTTACAAAATGTTTATTTGGCAGATGGTTTGAAGAAATCCAATGAAGATGCTGATAATATTGTTTCATTAACTAGAAAGCTGTGCAGCTTCATGATCATGGTTCCAGGTAATTTGGAACACGGAGCTATGTATATTCCAAAGAGCATATTATCCTTGCTTGATTCACAATCATGGGTTACACCAAAATTAAGGATAAGGGTATTATGTTCTCTTCTTTCATTATCTGCAACATTTGCTCAAAATGAGCTCCCATATCATGCAATTCATGAAGAGGTTATTGGCAATGATCGTTTATTTCTTGGTGATGCAACGTATTCTCAAGAACTCGGGTTGTTATCTAGGGTTATCCTTCAAAACATGGTCGACACTATTGAAAAAGAATCATCACAGGTCACGCGAGGAAAACTGGCACTTGAAGCTTGCAATTGCATCGCCTCATTTTTGAAAGTGAATATTGAGATATCGTCTGTATGCGCTAAGTTGATGGAAACGGCGGTATCATGTCTTGGAGGTGATGATAAATATTTGCAGTCAACTACTGATTTTGTGCATAAACAATCCCCAATACCTGTTGGGGGAGAATGA 2736 37.72 MEFKPRDYRAQEEAYSLNRVSVSSHPLCSSSVSSNTQDNVSIEFFDPLRGLSTEMPETVEDTVFAEKHSASQTASHLSAKEWTLFNRLLMQKFPVPKMISVSAFSSKTIRGKKAIGESPLNTQSDELNDSEKLSEKGFKTVSQQEYVKRLHELKDEITRSWRSGDRVSSLKLSIKVARLLMDTCVAQFYPTLFVLATDIMDMLGDMVWDRIREKAEFADDGTRICTLSDDFQANNICLEAKETCNNWFRKIASIHELLPRIYLELAILPCWRFLRDDVTDDIMRLVMMIRGIADPLASAYCRFFLIHCAQKLPKRDTGHLVTCISDQKIILKQIVSTKVTKYGNFLGDHKLLISLMEPTIEYTVRCIFKDPNKVDDMIVRLELGKSPLKLNGKVPLISIILHYLLKELPVEIVCSNALEILHLVDCSNDFSFDQCLNYKTLGLKLCEGIDQVNTVDAVIDEVIQAATKRKILDEYLKILDAYMDIILYYKMDQSLSFILSEIFERLCNEVVTEDEMASLQSIVVKLVTHFDDMKYVFDLNYFVDILDVMHGSSRSLVCMHILTNATRKDRIDDSTTIKLLFDVAQSLHDNVDFSNTRQDDNQQAERLVARFVDKVDHGMELDRHLTFLVECRGAFGSMNDLMEILVHSSNLLATRALKEKKNNLNFIKSCITFNEVTIPCIPSYSRQLILYLETAEVSLSGGLISHSDGLLDSAVCCLQNVYLADGLKKSNEDADNIVSLTRKLCSFMIMVPGNLEHGAMYIPKSILSLLDSQSWVTPKLRIRVLCSLLSLSATFAQNELPYHAIHEEVIGNDRLFLGDATYSQELGLLSRVILQNMVDTIEKESSQVTRGKLALEACNCIASFLKVNIEISSVCAKLMETAVSCLGGDDKYLQSTTDFVHKQSPIPVGGE 911
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cobi4g02817 911 PANTHER ESOPHAGEAL CANCER ASSOCIATED PROTEIN 2 903 IPR029705 GO:0005768(PANTHER)|GO:0032456(InterPro)|GO:0032456(PANTHER)
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cobi4g02817 K25731 VPS35 endosomal protein-sorting factor-like
leaf

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 Duplicated-type
Cobi Cobi-Chr3:6020302 Cobi4g02817 Cobi-Chr4:75914262 dispersed