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Gene details

leaf

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Cobi4g02906 ATGGAGTCGATACTGGCTCGAGCGCTGGAATATACTCTCAAGTACTGGCTTAAATCCTTCACCAGAGATCAGTTCAAGTTACAAGGACGCACCGTTCAGCTCTCCAATTTAGATATAAATGGTGATGCTTTGCACGCCAGTCTTGGATTGCCTCCTGCGTTGAATGTGACAACTGCTAAAGTCGGGAAGTTAGAGATTATACTCCCTTATTTCAGCAATGTCCAAGTTGAGCCAATTGTTGTGCAAATTGATAAGCTTGATTTGGTATTGGAGGAGAATGATGATTTGGATGCATATGCAAGCACAGAGAGTGCACAAATGCCATCCAGTCCTGCAAAAGGCAGTGGGTATGGGTTTGCTGACAAGATCGCAGATGGAATGACATTGGAGGTACGAACTGTTAATCTTTTACTTGAGACTCATGGAGGTGCTAGACATCGTGGAGGAGCAACTTGGGCATCACCAATGGCATCTATTACTATTCGCAATCTCTTGCTATATACCACAAATGAGAACTGGCAGGTTGTAAACCTTAAGGAAGCTAGGGACTTCTCTAATGACAAGCAGTTTATCTACGTGTTCAAAAAGCTTGAATGGGAGCATCTATCAATCGACCTATTGCCTCATCCTGATATGTTTGCAGCATTTGCTGAAGGCGCGTTTAAGGATGATGACGGTGCTAAGCGAGTATTTTTTGGCGGGGAGCGGTTTCTTGAGGGAATATCTGGAGAAGCTTATATCACCATCCAAAGAACAGAGCTTAATAGTCCATTAGGTTTGGAACTCCAGTTACATATTACTGAAGCAGTGTGCCCAGCTTTGAGTGAGCCAGGATTACGAGCTCTTCTTCGCTTCTTTACGGGATTTTATGTCTGTTTAAATAGAGGAGATGTGAATCCAAATGCTCAAGAGCGATCAGCAGAAGCTGCAGGGCGTACACTGGTCTCTATAATGGTGGACCATATATTTTTTTGCATTAAGGATACTGATTTCCGGTTAGAACTTTTGATGCAGTCACTTTTCTTTTCTCGGGCAAGTCTTTCTGATGGAGAAATCACCAAATGCTTAACTCGGGTGATGATAGGTGGTCTGTTTATGCGGGACACTTTCTCTAGCCCACCATGTACATTAGTGCAACCATCAATGCAGGATACTACAGACGAACCGCTTCACATCCCAGATTTTGGAAAAGATTTCTGTCCTCCAATATATCCTTTAGGGGATCAGCAATGGAAAGTAAATGACCATGCTCCACTCATATCCCTCCATAGTCTTCAGTTTATTCCCTCACCTAACCCTCCATCTTTCTCTTCACAAACTGTCATCGACTGCCAGCCTCTTATGATACATCTTCAAGAAGAATCTTGTCTAAGAATATCATCCTTACTAGCTGATGGAATTTTGGTCAACAATGGTGACATTTCACCCGACTTCTCGGTCAACTCACTTGACTTCAAAGTCAAAGGATTAGACATCACCGTTCCACTGGTCAACGAGAGCTCCTTCACTGGAGCAAGGCTTCATATTGAAAACCTATACTTTCAAGATTCCCCTTCCCTACGCCTCAAACTACTCAATCTTGAAAAAGATCCTGCATGCTTCTGTTTATGGAAAGGTCAACCCATTGACTCCAGTCAAAAGAAATGGACAAGTGGCGCTTCTCTTATAAACATGTCTTTAGAAACACATAACTATAATAATAGTTCCAAAAAGGTTAACGGGTCCCGCTCACACTATTCAGATTTATGGAGGTGTGTAGAGATGAAAGACGTTTGTGTCCAGGTGGCAATGGTAACCGCAGACGGAAGCCCATTAACGGACATACCTCCACCCGGAGGTGTCGTTAGGGTTGGAGTCGCGTGTGAACAATATCTCTCAAACACATCTGTTGAACAGTTATTCTTTGTGTTGGATCTTTATACGTATTTTGGTACAGTCAGCGAGAAAATGGCAATGGTGGGAAAAGATAAACGAAAAAAGTCGATTAAACGTGAGTTGTCGGATGGGAGTTTGATTGAAAAGGTTCCTGGTGATACGGCTGTTAGCTTATCGGTTAAGGATCTAAAGCTAACATTTCTAGAAGCTTCTAATTTGGATATTCAAGGAATGCCTTTAGTTCAGTTTGTTGGTGATGATATGTTCATGGAAGTTACTCATAGGACCTTGGGTGGGGCCATGGCCATTTCATCAAATTTAAGGTGGGACCGGGTCCAGGTGGACTGTACAGAAACTGAAGGAAACTCGATAAATGCAAATGGTAAACTGAGAGCTGTATTTTGGGTGCAAAATGAAAGAAAGATTCCGTTTTTGGATTTGCGTATGGTGCATGTTATTCCGTATAATGCACGGGATACCGAGTGTCATAGTTTAAGTGTGTCAGCTTGTGTAGCGGGTGTACGCCTGGCAGGTGGAATGAACTATGCTGAAGCTTTGCTTCACCGGTTCGGAATTCTGGGCCCAGATGGTGGGCCAGGGGTTGGGCTTTCTAAGGGCTTGGAGCATTTATCATCTGGCCCGTTTTCAAAGCTTTTCAAAGGTTCACCTCTGCTAGAGAGTAAAAGTGAAGGCATAGAGTCAGATAAGAATAGTGGTTACTTGCAATTGGGTCCACCAGATGATGTGGATGTATCACTAGAATTAAACGACTGGTTATTTGCATTAGAGGGTGCTGACATGGCAGAAAAGTTGCGGTTCTATAATTCAGAAGATTCTTACCGAGAAGAAAGTTGCTGGCACACAACTTTTGACAGTTTCAAAGTCAAAGCAAACAGCAGTAAAAAACACTCGCTTAATAACAAAAAGATATTACCTGGAGCACTAAAGTATCCTGTTGAATCTGTTACAGTTGGTGTTGAAGGCTTGAAGACATTAAAACCCCAGATGCAAAAAGTAACTGCAACCTCAAACGGGCACAGGCAAACTGTAGAGTCACATGGTGGTGTTGACCTTGAAGCTGACGTTGTATTGCATGAAGATGATGGTGCCAGTGGCGGGATCAAATGGGTAGTTGAAAGTTTAAAGTTTTCTGTGAAACATCCGGTTGAGGCAGTTGTTACCAAGGATGAACTGCAACATGTTGCTCAATTATGCAAGTCAGAAGTGGATTCCATGGGCCGAATAACTGCTGGTGTTTTGCGTGTGTTAAAGTTAGAAGGGTCAGTCGGTCAGACAGCAATGAATCAACTAAGCAACCTCGGAAGTGAAGGGTTTGAAAATATCTTCTCACGCAAAGATAGTAACGGTTCTAGTGTCGGCTTGATTCCCTCTTCATTTTTGGCTTCAAATAACCAACAGTCTTCTTCGCCTGATCCAACATTAAGCTCACTCGAGGCTGCATTATTAGATTCACAGTCAAATTGTGCAGCTCTTGTGGCAGAATTAAGCAGTTCTGAATCTTCGAAACAACACGTTGATAGTGTAGAACAACTTGCCCAGAAACTGGAGAGTATGCAGAAACTGTTATCAGAGTTGCGGACTCGGGTATAG 3486 42.89 MESILARALEYTLKYWLKSFTRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHASLGLPPALNVTTAKVGKLEIILPYFSNVQVEPIVVQIDKLDLVLEENDDLDAYASTESAQMPSSPAKGSGYGFADKIADGMTLEVRTVNLLLETHGGARHRGGATWASPMASITIRNLLLYTTNENWQVVNLKEARDFSNDKQFIYVFKKLEWEHLSIDLLPHPDMFAAFAEGAFKDDDGAKRVFFGGERFLEGISGEAYITIQRTELNSPLGLELQLHITEAVCPALSEPGLRALLRFFTGFYVCLNRGDVNPNAQERSAEAAGRTLVSIMVDHIFFCIKDTDFRLELLMQSLFFSRASLSDGEITKCLTRVMIGGLFMRDTFSSPPCTLVQPSMQDTTDEPLHIPDFGKDFCPPIYPLGDQQWKVNDHAPLISLHSLQFIPSPNPPSFSSQTVIDCQPLMIHLQEESCLRISSLLADGILVNNGDISPDFSVNSLDFKVKGLDITVPLVNESSFTGARLHIENLYFQDSPSLRLKLLNLEKDPACFCLWKGQPIDSSQKKWTSGASLINMSLETHNYNNSSKKVNGSRSHYSDLWRCVEMKDVCVQVAMVTADGSPLTDIPPPGGVVRVGVACEQYLSNTSVEQLFFVLDLYTYFGTVSEKMAMVGKDKRKKSIKRELSDGSLIEKVPGDTAVSLSVKDLKLTFLEASNLDIQGMPLVQFVGDDMFMEVTHRTLGGAMAISSNLRWDRVQVDCTETEGNSINANGKLRAVFWVQNERKIPFLDLRMVHVIPYNARDTECHSLSVSACVAGVRLAGGMNYAEALLHRFGILGPDGGPGVGLSKGLEHLSSGPFSKLFKGSPLLESKSEGIESDKNSGYLQLGPPDDVDVSLELNDWLFALEGADMAEKLRFYNSEDSYREESCWHTTFDSFKVKANSSKKHSLNNKKILPGALKYPVESVTVGVEGLKTLKPQMQKVTATSNGHRQTVESHGGVDLEADVVLHEDDGASGGIKWVVESLKFSVKHPVEAVVTKDELQHVAQLCKSEVDSMGRITAGVLRVLKLEGSVGQTAMNQLSNLGSEGFENIFSRKDSNGSSVGLIPSSFLASNNQQSSSPDPTLSSLEAALLDSQSNCAALVAELSSSESSKQHVDSVEQLAQKLESMQKLLSELRTRV 1161
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Cobi4g02906 1161 Pfam VPS13-like, N-terminal 1 103 IPR026854 -
Cobi4g02906 1161 Coils Coil 1140 1160 - -
Cobi4g02906 1161 PANTHER UNCHARACTERIZED 1 746 IPR026728 -
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Cobi4g02906 - -
leaf

Event-related genes

Select Gene_1 Gene_2 Event_name
71930 Cobi3g02666 Cobi4g02906
leaf

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 E-value Duplicated-type
1798456 Cobi Cobi3g02666 Cobi-Chr3:78903711 Cobi4g02906 Cobi-Chr4:77552125