Asteraceae Genomic Research Platform
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Ecan3g02350 | ATGGAATCGATAATAGCAAGGGCGCTGGAGTATACTTTAAAGTACTGGCTTAAATCATTCACTAGAGATCAGTTCAAGTTACAAGGACGCACTGTTCAGCTCTCCAATTTAGATATAAATGGTGATGCTCTCCATGCGAGTCTCGGATTGCCTCCAGCATTGAATGTTAAAACCGCAAAACTCGGGAAATTAGAGATTATACTTCCTTATTTGAGCAATGTACAAGTTGAGCCAATTGTTGTGCAAATTGATAAGCTTGATTTGGTTTTGGAGGAAAATGATGATTTGGATGCATATAAGAGTACAGACAGTGCACAAACGCCATCCAGTCCTTCAAAAGGCAGTGGATATGGATTTGCGGACAAGATTGCAGATGGGATGACACTGGAAGTACGGACTGTCAATCTTTTATTGGAGACACATGGGGGTGCTCGACATCGGGGAGGAGCAACTTGGGCATCACCAATGGCATCTATTACCATACGCAACCTCTTGCTATATACCACAAATGAGAACTGGCAGGTGGTAAACCTTAAAGAAGCGAGGGATTTTTCAAATGACAAGAAGTTCATCTATGTTTTTAAAAAACTTGAATGGGAGCATCTATCCATCGACCTCTTGCCTCACCCTGATATGTTTGCAGCGTTTTCTGAAGGTGCATTTAAGGATGACGATGGTGCAAAGCGAGTATTCTTTGGCGGGGAGCGGTTCCTAGAAGGAATTTCCGGAGAAGCTTATATTACGATACAAAGGACAGAGCTTAATAGTCCACTAGGGTTGGAACTCCAGCTACATATTACTGAAGCTGTGTGCCCAGCTTTGAGTGAGCCAGGACTGCGAGCTCTTCTTCGTTTTTTTACGGGATTGTATGTCTGTCTAAATAGAGGAGATCTGAATCCAAATGCTCAAGAGCGATCAGCAGAAGCTGCAGGGCGTACACTGGTCTCTATTATGGTGGACCATATATTTTTTTGCATCAAGGATACTGATTTCCAGTTAGATCTTTTGGTGCAGTCGCTTCTCTTTTCCCGGGCAAGTATTTCTGATGGAGAGATAACCAAATGCTTAACTCGGGTGATGATGGGTGGACTATTTCTGCGGGATACTTCCTCTCGTCCACCATGCGCTCTAGTGCAACCGTCAATGCAGGATGCTGCAGATGAACCACTGCAAATTCCAGATTTTGGAAAGAACTTCTGTCCTCCAATATACCCGTTAGGGGATCAGCAGTGGAAACTAAGTGAACGCGCTCCACTTATGTCCCTCCATTGTCTTCAGTTTATGCCTTCACCTAGCCCACCATCCTTCTCTTCACAAACTGTCGTTGACTGCCAGCCTCTTATGATACATCTTCAAGAAGAGTCGTGTCTAAGAATTTTATCCTTACTAGCTGATGGAATCGTGGTAAATTCTGGTGGTATTTTACCAGATATTTCAGTCAACTCCCTTGAAGTCAAAGTCAAAGGATTAGATATTACTGTTCCATTAGAAAATCAAAATGACAGCTCCTTTAGTGGAGCAAGACTTCATATTGAGAACCTATTCTTTCATGATTCACCTTTCCTGAGGCTTAGACTGCTCAATCTTGACAAGGATCCTGCATGCTTCTGCCTCTGGAAGGGTCAACCAATTGATGCCAGCCAAAAAAAATGGACAAGTGGAGCTTCTTTATTCGATATGTCTCTAGAAACTTGTGATAGCTTAAAAGGAGTAAATGGGTCCCGTTCACAATCTTCAAAGTTGTGGAAATGTGTCGAGGTAAAAGGTGTTTGTATTCAGGTTGCAATGGTAACAGCAGATGGAAGCCCATTGATAGACGTCCCTCCTCCAGGAGGAGTTGTTAGAGTTGGAGTTGCTTGTGAACAATATCTCTCCAACACTTCTGTTGAGCAACTTTTTTTTGTATTGGATTTATATACGTATTTTGATACAGTCAGCGAGAAATTGGCCGTGGTTGGAAGAAGTAAACAGAAGAAGGCGGTGAAGCATGAACTTTCTAATGGAAGCTTGATCGAAAAGGCTCCTGGTGATACTGCAGTTAGTTTAGCAGTTAAGGACCTTAAACTTACATTTTTAGAATCTTCCTTGGTGGATTTTCAGGAAATGCCTCTAGTTCAGTTTGGCGGAGATGATCTATTGGTGGAAGTTACTCATAGAACCTTGGGTGGTGCCATGGCCATTTCATCAACTGTAAGGTGGGACAGTGTTCAGGTTGACTGTGCCGAAACTGAGACAGCCCCAGTACATTCGAACAGTTTGGTGTCAAATGCTACAGAAGATTTTCTTCCTGCTCTAAATGGCTGTCCTAAACTGAGAGCTGTCTTTTGGGTGCAAAATGAAACAAATTTTCCGTTTTTGAATTTAAGCATGGTGCATGTTATTCCTTATAATGCACGAGATACCGAGTGTCATACGTTAAGTGTGTCGGCTTGTATCGCCGGCGTACGTCTTGCAGGAGGCATGAATTATGCCGAAGCTCTCCTACATCGCTTTGGAATTTTAGGACAAGATGGTGGGCCAGGGGATGGGCTCTCCAAGGGTTTGGAACATCTATCTGTGGGCCCATTGTCGAAACTTTTCAAAGCATCACCTTTGCTTGTTGAGGCCAGGGAGAGTAAAAGTGAAAGCATAGAGGAGAATCATAGTGGACATTTGCTCTTGGGTGCACCTGATGATGTGGAGATATCTCTAGAATTGAAGGACTGGTTATTTGCATTGGAGGGTGCAGAGATGGCAGAAAGGGCATGGCTCTACAGTCCTGAGGATTTTTACAGAGAAGAGAGGTGCTGGCACACAACTTTTGACAGTTTTAAAGTGAAGGCAAACAGCAGCAAAAGACACTTGGTTAATGGCAAAAAGAGTTTATCTGGTGCACTCAAGTATCCTATAGAATCAGTGACGGTCGGTGTTGAAGGATTAAAGACGTTGAAACCCCAGCAGCAGAAAGTAGCACAACAAAATGGGCACAAACAAACTGTCGAGTCACATGGTGGGGTAGATCTTGAAGCTGACATAGTTTTAAACGAAGATGATGGTGTCAATGGGATGATCAGTTGGGTGGTGGAAAGCTTAAAGTTTTCTGTGAAACATCCGGTTGAGGCAATTGTAACCAAGGATGAGCTGCAACATGTTGCTCAATTATGCAAGTCAGAAGTTGATTCCATGGGGAGAATAACTGCTGGGGCTTTGCGTGTGTTAAAGTTAGAAGGATCAGTTGGTCAGACAACGATGGATCAGCTGAGCAGTCTTGGAAGTGAAGGGTTTGAAAAGATCTTCTCACCAGTTAACCATCGCAGAGATAGTAATGCTTCTGGTGGAATGAGCCCTTTTTCCCTAGGGGCTTCTGAAAACCAACTCTCCTCATCCTTTAATACAACATTATCCTCTCTCAAGGCTGCATTATTAGAATCACAAACAAATTGTGCATCCCTTGCTTCTGAGTTAAGCATGTCTGAACCACACCTTCGTAGTGTGGAACAACTCGCCCAGAAACTAGAGAATATGCAACAATTGTTACTGAAGCTGCAGTCTCGGGTATAG | 3540 | 43.25 | MESIIARALEYTLKYWLKSFTRDQFKLQGRTVQLSNLDINGDALHASLGLPPALNVKTAKLGKLEIILPYLSNVQVEPIVVQIDKLDLVLEENDDLDAYKSTDSAQTPSSPSKGSGYGFADKIADGMTLEVRTVNLLLETHGGARHRGGATWASPMASITIRNLLLYTTNENWQVVNLKEARDFSNDKKFIYVFKKLEWEHLSIDLLPHPDMFAAFSEGAFKDDDGAKRVFFGGERFLEGISGEAYITIQRTELNSPLGLELQLHITEAVCPALSEPGLRALLRFFTGLYVCLNRGDLNPNAQERSAEAAGRTLVSIMVDHIFFCIKDTDFQLDLLVQSLLFSRASISDGEITKCLTRVMMGGLFLRDTSSRPPCALVQPSMQDAADEPLQIPDFGKNFCPPIYPLGDQQWKLSERAPLMSLHCLQFMPSPSPPSFSSQTVVDCQPLMIHLQEESCLRILSLLADGIVVNSGGILPDISVNSLEVKVKGLDITVPLENQNDSSFSGARLHIENLFFHDSPFLRLRLLNLDKDPACFCLWKGQPIDASQKKWTSGASLFDMSLETCDSLKGVNGSRSQSSKLWKCVEVKGVCIQVAMVTADGSPLIDVPPPGGVVRVGVACEQYLSNTSVEQLFFVLDLYTYFDTVSEKLAVVGRSKQKKAVKHELSNGSLIEKAPGDTAVSLAVKDLKLTFLESSLVDFQEMPLVQFGGDDLLVEVTHRTLGGAMAISSTVRWDSVQVDCAETETAPVHSNSLVSNATEDFLPALNGCPKLRAVFWVQNETNFPFLNLSMVHVIPYNARDTECHTLSVSACIAGVRLAGGMNYAEALLHRFGILGQDGGPGDGLSKGLEHLSVGPLSKLFKASPLLVEARESKSESIEENHSGHLLLGAPDDVEISLELKDWLFALEGAEMAERAWLYSPEDFYREERCWHTTFDSFKVKANSSKRHLVNGKKSLSGALKYPIESVTVGVEGLKTLKPQQQKVAQQNGHKQTVESHGGVDLEADIVLNEDDGVNGMISWVVESLKFSVKHPVEAIVTKDELQHVAQLCKSEVDSMGRITAGALRVLKLEGSVGQTTMDQLSSLGSEGFEKIFSPVNHRRDSNASGGMSPFSLGASENQLSSSFNTTLSSLKAALLESQTNCASLASELSMSEPHLRSVEQLAQKLENMQQLLLKLQSRV | 1179 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Ecan3g02350 | 1179 | Pfam | VPS13-like, N-terminal | 1 | 102 | IPR026854 | - | |
| Ecan3g02350 | 1179 | PANTHER | UNCHARACTERIZED | 1 | 1176 | IPR026728 | - | |
| Ecan3g02350 | 1179 | Coils | Coil | 1158 | 1178 | - | - |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Ecan3g02350 | - | - |
| Select | Gene_1 | Gene_2 | Event_name |
|---|---|---|---|
| 84928 | Ecan3g02350 | Ecan8g02438 |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | E-value | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 2137692 | Ecan | Ecan8g02438 | Ecan-Chr8:35853517 | Ecan3g02350 | Ecan-Chr3:34120493 | |
| 2143720 | Ecan | Ecan3g02350 | Ecan-Chr3:34120493 | Ecan8g02437 | Ecan-Chr8:35847200 |