Asteraceae Genomic Research Platform
| Select | Gene | Cds | Cds_length | GC_content | Pep | Pep_length |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Laca7g03076 | ATGGAATTCAAAACGCGTGATTACAGAGCCGAAGACAAAGTCTATTCACTTACCCGAATTTCGGTTTCTTCGCATCCTCTCTGCTCGTCAGCATCTTCATCCTTATTACATACACAGGATCATGGGAGCACTGAATTCTTTGATCCATTAAGGGGGCTATCAACAGAAACGTTGGAGCCAGTTGAAAATACGGCAGTTGCAGAAAAGCTTCCTGCTACCCAACCAACCTCTCATCTCTCTTCAAAGAAGGAGTGGACATCCTTTAATAAGCTACTAATGCAGAGATTTCCTGTCCCAAAAATGATTTCAGTTTCTTCGTTTTCAAGCAAAACCATAAAAGGCGGCAAGGCAAGTGGAGAACTATCATCAAATATTCAGTCAGATGAATTGAATGATTCTCAAAAGTTGAAGGAAGGAGGATTCAAGATTGTTAGCCAGCAGGAGTACATTAAACGGATGCATGGACTTAAAGATGAGATCATGCGTTCTTGGCATTCTGATGATCGTGTAACAACCTTAAAGTTGTCAATTAAGGTTGCTAGGCTTCTGATGGACACATCTGTGGCACAATTTTATCCAACATTATTTGTTCTTAGTGCTGATATAATGGACATGCTTGGTGATATGGTATGGGATCGGATTAAACAGAAAGCCGAGTTTGCAGATGATGGAACTAAAATATGCTCTTTATCAGATGACTTTGATGCAAATAGTATATGCTTTGAAGCTAAGGAGACATGCAACAATTGGTTCAGAAAAATTGCTTCCATCCACGAGCTTCTTCCACGCATCTATCTTGAGCTTGCGATATTGCCATGCTGGCGATTTTTGCATGATAATGTGATGGATGACCTCATGCGATTGGTTACAATGATAAGAGGGGTTGCAGATCCATTAGCATCAGCCTACTGTCGCTTCTTTTTGCTTCACTGTGCCCAAAAACTTCCCCAACTCGATACAGGGCATCTGATAGCATGCATTAGTGACACAAAAGTTGTACTTACACGGATTGTATCCATGAAAGAAACCAAGTATGGGAACTTTTTGGGAGATCGAAGGTTGGTTATCAGCTTGATGGAACCAACAATTGAGTATACTATGAAATGCATTTTTAGGGACCCAAATCAGGTTGCTGATATGATTGTGAGACTTGGATTAGGGAATAATTCTTTGGAGTTATATGGAGAAGTTCCTTGGATATCGATTATTCTCCATTATTTACTCAGGGAACTTCCAACTGATGTAGTATGTTCCAATGCTGTAGAATTTCTTCACCTTGTTGACTGCAGCTCTGATTATTCGTTTGACCAGTGTTTAAATTACAAGGTGCTTGGGCTGAAGCTTTGCGAGGGAATATCTCAAGTGAACACAGTTGATGTATTAATTGATGAAGTAATTCAGGTTGCTACAAAAAGAAAGAGCCTTGATGAGTACTTGAAGATCTTGGATGCCTATATGGATATTACTCTTCAATATAAGACTGATCAGTATCTAAGCTCCATTCTAAGTGAAATATTTGAGAGATTATGCAATGAAGTGGTTACTGAAGATGAACTAGCTAGCCTGCAATCAATTATTGTGAAACTGGTCACACATTTTGATGATATGAAACATGTTTTTGATCTGAACTATGTTGTTGACATATTAGATGTAATGCATGGAAGCTCAAGAAGCATTGTGAGTATGCACATCCTCAATAATGCCACAAGAAATGATGACATCAGTGATCCTACCACAATAAAACTTCTTTTTGATGTTGCCCAGTCTCTGCATGATAGTGTTGATTTCTCAAGCACAAAACAGGATGATAATCAACAAGCTGAGCGATTAATTGTTCGTTTTATAGATAAGGTTGACCATGGTGTGGATTTGGACCGATATTTGACTTTCTTGATTGAGTGTCGTGGAGCTTTCAGCAGCATGAATGATCTGAAGGAGATTCTTGTTCATTCCAGCAATCTTTTAGCAACCAGAGCTTTAAGATTGAGAGAGAAAAAAGATACTTCAAATTTTATAAAATCCTGCATTACTTTTAATGAAGTTACAATACCCTGTATTCCATCTTATTCCAGGCAGTTAATCTTATACCTTGAGACCGCAGAGGTTTCTTTGTTGGGTGGTTTGATTTCTCATTCAGATGGGCTTTTAGACTCTGCTATCAGCTGCTTACAAGATGTTAACTTGGTAGATGGCATGCGTAAGAATGAAGATGCTGATGGTATTGTTTCCTTAATGAGAAAGCTCTGCAGCTTCATGCTTATGGTTCCAGGTAATTTGGAACAAGGAGTTACCTACATTCCAAAGAACATATTATCCTTGCTTGATTCCCAATCATGGATTACACCAAAATTAAGGATACGGGTTTTATGTTCACTTCTTTCCTTATCTGCAACATTTTCTCAAAATGAGCTCCCTTATCATCCAATTCATGAAGAGGTTTTTGGCAATGACAGTTTATTCTTTGGTGATGCAAGATACAGCCAAGAACTTGTATCATTATCTACTCTTATTCTTCATAACATGGTTGATATTATTCCACAAGAATCTTCACAGGCTACACGAGGAAACTTGGCACTTGAAGCTTGCAACTGTATTGCCATGTCTTTCAATGTGAATCAGGAGATATCTTCCGTATGCTCTAAGTTGGTGGAGATCGCCAGATCATGTCTTGGGCCTGCTGATAAATATTTGCAATCGACTATCAATTTTGTGCATAAACAGTCCCCGGTGTCTGTTGGGGGAAAATGA | 2748 | 38.76 | MEFKTRDYRAEDKVYSLTRISVSSHPLCSSASSSLLHTQDHGSTEFFDPLRGLSTETLEPVENTAVAEKLPATQPTSHLSSKKEWTSFNKLLMQRFPVPKMISVSSFSSKTIKGGKASGELSSNIQSDELNDSQKLKEGGFKIVSQQEYIKRMHGLKDEIMRSWHSDDRVTTLKLSIKVARLLMDTSVAQFYPTLFVLSADIMDMLGDMVWDRIKQKAEFADDGTKICSLSDDFDANSICFEAKETCNNWFRKIASIHELLPRIYLELAILPCWRFLHDNVMDDLMRLVTMIRGVADPLASAYCRFFLLHCAQKLPQLDTGHLIACISDTKVVLTRIVSMKETKYGNFLGDRRLVISLMEPTIEYTMKCIFRDPNQVADMIVRLGLGNNSLELYGEVPWISIILHYLLRELPTDVVCSNAVEFLHLVDCSSDYSFDQCLNYKVLGLKLCEGISQVNTVDVLIDEVIQVATKRKSLDEYLKILDAYMDITLQYKTDQYLSSILSEIFERLCNEVVTEDELASLQSIIVKLVTHFDDMKHVFDLNYVVDILDVMHGSSRSIVSMHILNNATRNDDISDPTTIKLLFDVAQSLHDSVDFSSTKQDDNQQAERLIVRFIDKVDHGVDLDRYLTFLIECRGAFSSMNDLKEILVHSSNLLATRALRLREKKDTSNFIKSCITFNEVTIPCIPSYSRQLILYLETAEVSLLGGLISHSDGLLDSAISCLQDVNLVDGMRKNEDADGIVSLMRKLCSFMLMVPGNLEQGVTYIPKNILSLLDSQSWITPKLRIRVLCSLLSLSATFSQNELPYHPIHEEVFGNDSLFFGDARYSQELVSLSTLILHNMVDIIPQESSQATRGNLALEACNCIAMSFNVNQEISSVCSKLVEIARSCLGPADKYLQSTINFVHKQSPVSVGGK | 915 |
| Select | Seq ID | Length | Analysis | Description | Start | End | IPR | GO |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Laca7g03076 | 915 | PANTHER | ESOPHAGEAL CANCER ASSOCIATED PROTEIN | 2 | 907 | IPR029705 | GO:0005768(PANTHER)|GO:0032456(PANTHER)|GO:0032456(InterPro) |
| Select | Query | KO | Definition | Second KO | KEGG Genes ID | GHOSTX Score |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Laca7g03076 | K25731 | VPS35 endosomal protein-sorting factor-like |
| Select | Gene1 | Location1 | Gene2 | Location2 | Duplicated-type |
|---|---|---|---|---|---|
| Laca | Laca-Chr1:137215714 | Laca7g03076 | Laca-Chr7:145451138 | dispersed | |
| Laca | Laca-Chr3:146354812 | Laca7g03076 | Laca-Chr7:145451138 | dispersed | |
| Laca | Laca-Chr3:174128166 | Laca7g03076 | Laca-Chr7:145451138 | dispersed |