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Gene details

leaf

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Nenu1g00485 ATGTCTACGCCGATAGGTGATTCCATGTCTTCCCCTGTCGATTCACTAACAATGAGTTTCGGCTTAGTTCCTCCAACAGCTGTTCCTGCAATCCTCGATTGCATTTTAAGTTCTACTAGATTATCTCCGTCCTTGCTTTTCTCCTCACTCCTGGATGCTTTTTCGAATGTTATAAAGGACGATTCCAAGGAGGAGCACGAGAAACTGGATTCTGCTTACTCAAGCCGCATAGTGTCCTTTGCGAGTGCACTCTGTCACCTTCTGAAGAAATCCGGGACTAATCCTGATTCTCTGCGATCTTTTATATGGAAAGGTTTCTTTCCAGTAATTAAAATATATTCTAATGATTATGAGTTACTTAACCAGATTGCAGAATTACTCTTCGCTATTGTGGTTGAAACAAATACCTGGGGGGTCTTGGAAGCAACCTTGGTGCCCATTTGCTTGATGTCTATTGGCCATTCTCTGGGCATGTTACAAAACGAAGACTCAACCATCTTTCAATGGGATATGCAATCAATTATTCTGGAGTCAACTGATAAGCTCAGTTATTTGAATATAGAGAAAGAGTTGCTGCTCTCTCACTTTGGATCGTTGCCATTGCCTGTATCATGCCATATTTTAACTTCACTATTATTTTCTGCTCTAAGAAGTCATCAAGCAGTACACAACACATCAGAACCAGTGGTGGCTAATGGGTGTTGTGCAGGAAATTTTGCTGGAAAATTGCTTTGGCATCTATGTGATATGTCAATCCAAATACTTTTACAATCTTCTGAACACCGCTTCTGTGCGATCCACCTTCTCCTTCCATTTGTTTTCAGGGCATTTGTTTCTCACAGTCATTTTGAAATTGCAGTACATGGGAAGAAGCATGTCCTTTCCAGGGAGTACTTATTTACAAAAATATGGAAGTGCTGCAAAACACTCTTGTCTCTTGGACCTTTAGAGCGAAGGGATGCATATAATGTTTTGTCTCTATATTTGTCTTCCTCACTTCATATGGATGGGTGTGAAGTTTCTGTGTGTAATGGGGAAGATAATTTGGATTTAAAATCTGAAAAGGAGTTTTGGGATGAAATAAAAAGAGGCCTGGTTGATAAGGAAGGTTTTGTGAGGAAGCAGTCATTTCACATACTTAAAACAGCATTAAGCAGAAGTGGTGGAAGCCAATGCTGCAGTGGTGTTTCAGAAGCAACTTCATTTGAAAAAAGTTCAACTTCTTGTGGTATGACAAAGAGAGCACAGTGGGCTGAAAAGGAAGCCAAGTCATTGGGCGTGGGGAAAATATACAATTCAGCCAGTCCCTGCTTGAATAGCCAACAGAGATGGGACGCATTCCTACTTCTATATGAAATGCTTGAAGAATATGGGACACACTTAGTTGAAGCAGCTTGGACTCACCAGATAACATTGCTGCTTCATTTTTCTTGTCCACATGATTATTCACTGAACTCCAAAATTGAAGGATCTTACCAATTCCAGATGGAAACTTTAGAGGGAATCTTTAGCTGGTTAGCAGTTTTATGGGAGCGAGGCTTTTGCCATGAAAATCCTCAAGTTAGGTGCTTGATCATGCAGTCATTTTTGGGCATTGATTGGAAGAATCATGGGGAATGGGCTAAACTAGTGCCTAAAAGTTTTGTACTCGGTCCTTTTATACAAGGACTGAATGACACTGTGCACCACAAGGATTTTGGTGTAAAAGGAATTTATTCTTCAACAACAATTGAAGGTGCAGCCAGTTTTTTCTGTCAGTTCTCCAGTTATCTTTGTGGGAGGGAATTGGTTGCATTTCTGTTCAATCTAGCATCTGTTGCTAAAGTGGAGTCCTTTGGGAGGGCTGGATTAATGGCTCTTTCTGTTTGCATTGCTTCAGCTGCTTGCGGAGCTGAGGCACCTTGTGAAAGGGAAGCACAGTTGTGTGAAAATGATTCCTTTAATACAGTGCAAGTGGATTCAGATTCTTCTGAAGAATGTGTGCTCAGCAATTGCAAGGCAGACTTATTAGATGCTCTGAGGCTTATTATTGAAGGCGGCAAACAACATTTTAATCCTAATTATCGTCTTCGAGTTTGTGAGAAAGTACTAGAGGTTGCTTGTTCCATGATGTGTCCCTCTGATGTGCCTCTTGAGATACTCATGCATTTTTTATCTTCACTGCCACGAGAGTTCACGGATTTTGGTGGTTCCTTTAGAGGAAAAGTACAAAAATGGTTTTCTGGGTGCAATAAGAAGGATAATGGTTCAAGTACCTTCAGTGCCAAAATGCAGGTTTTGAAGAGTCTTCATGACTTCCCTAAAAGATTCATAAATCATCATTATTCCCATGATACTTACGATGATGAAGATTTGAAAGCTTGGGCATTGGAGGCACAAAGATGGACAAGGTTGCTTTTTCTAGTATTCACAGAGGAACAACATTTCGAACCTATATTCATGTTTCTTCAGAACTGTGGCATTAATATATGCAATCAAAAAGAAAATTTGGAATGGATTCCTGTGAAGTTTCTCATCCTTGCCTTTAGCTTAGTTCAAGAGTTACAGATGGTACAGGATAAGTACACTGATTTTACAATGAAAGTTCGAAGTCACATGGCAGTTGACATGCCCCAAAGCTATGATGAATTAAGTACAGAAGAAACTTTCATTGTTTCTGAAAAAGTTAGAACACCTTTTCTTTTTATATTGGAGGATTTTGTGTCATTTGCCAAATCAGCTTGTTCCATATTCTGGTCAAGTCCTATAATTGAGGATTTGCTTTTACCTTGTTCTGTCAGAGGCAAGCTTGGAGGACCTAGTCAACGACGCTTGGCTTCTTCTACAACAATGGCTGTGTTGCAAGCTATAGAGTCCATTCGAACTATTGCATCCATCTCATCTTGGTGTGCTCGTTTCCAAAATGACAGTTTTCTTGGTTATGCTTTTACTTTCTTATGGCGTTCATTTGCAAGAATTATTTCTTGTCCAACATTTGATTCAGAGATGGGAGCAGAAATTCGTCTTGCATCATATGAAGCATTGGTTCCTGTTTTGAAAGCACTAGGTTCTGCTTTTCCTTTGTGGGATTTTAATTCAATAATGACCAATGATGAATCTTTGCTGCCTAAATTAGAGGGCAAGCCGTTGCTGGATTCTTGGGTTTCAAATTTTCTTAATAACATCAATGATCTCCTTGCGGTTGGAATTTTGGCACGAAGTCGAAGGGCAGTTTTGATGAACTGGAAGTGGCACTGTCTTGACTCTTTATTGTCAATCCCATACCATGCCATCAAGAATGGGGTTCATCTGTGCAATAATGCTACTTTTTTCTCAGATGCAGCTCTTAGATGCATTTTTTCTGATATTATTGAGAGCCTTGAGAATGCTGGTGAAAATTCTGTGCTTCCCATGCTTCGATCTGTTAGATTTGTTTTGGGAATTTCTGCATCAGAAAGGATCTCTTCGCTTGTTTCCTCATGTGATGGTTTGGATATCCAGATAATGTGGCAGTTAGTACATTCTTCTTGGTTACTACATGTCAGCTGCAACAAGCGTAAAGTTGCACCTATTGCTGCACTTCTATCATCTGTTTTGCATATTTCTGTGTTCTGTGATGAGAGCATGCATGAAACAGCTGATAATGCTCAAGGTCCTCTGAAGTGGTTTGTTAAGAAAATTCTTGATGAAGGTGGAAAAAGTCCCCGTACCATTCGTCTTGCTGCATTACACCTGACAGGCTTATGGCTCTTATATCCAAGAATCATAAAGTACTACATTAAAGAGCTTAAGTTGCTTGCACTCTATGGTTCTGTGGCTTTTGATGAGGATTTTGAAGCTGAATTGGCTGAACAAGATGCAAGGACAGAGGTCTTATTACTAGCTAAAAGCCCAGATCCTGAGCTCACTGAAGCATTTATCAACACAGAATTATATGCACGCGTGTGTGTTGCTGTTCTCTTTGAAAAACTAGCAGACTTGTCCGATGGGTCGGGATTGATGAAGAGAAATGAAGATTGTTCTGCTGCCCTTGAATCTGGAAAGTTGTTTCTATTAGAACTCATTGATTCTGTGGTGAATGACAAAGATCTTTCGAAGGAGCTATATAAAAAATATAGTGCAATCCATAGGCGTAAAGTTCGTGCATGGCAAATGCTATGCATATTGTCACGGTTTGTTGATGAAGATATAGTTCAAGAAGTAACCTCTAGTTTGCACATATGTTTATATAGAAACAACTTGCCTGCTGTTCGACAATATTTGGAAACATTTGCAATCAATATTTACTTGAAGTTTCCTTTTCTAGTCCGGGAGCAATTAATTCCTATTTTCCTTGACTACAATATGAGGACGCAGGCGCTGTCTTCGTATGTTTTTATAGCAACTAATATTATCCTCCATACGAGTGAAATGCTTCTTCAGTTTAGACATTTGAATGACTTACTTCCTCCTATAATTCCTTTGTTAACCTCTCACCACCACAGTCTACGTGGGTTTACTCAGTTGCTAGTGTATCATGTCCTTTGCAAGTTGGTACCTGAGTTGGATTCTGATGTTTCTGAAGTCCCTTTGGAGAAAAAGTGCTTCCAGAGTTTAAAATCATATTTAATGAAAAATTCTGACTGCATGAGGTTAAGAGCATCAATGGAGGGATTTCTAGATGTATTTAGTCCCAAGGCCTCTACTATACCTGCTGGAATTTTTACAGCTCGAGATGAGGAATCGGAGTTTGAATGCGTCCCATTATCCCTCATGGAGCAAGTGATTGCATTTTTAAATGATGCCAGGGAAGACCTTAGATGTAATATGGCTAAGGATATTGTGACCATCAAGAATGAAAGTTTGACAATTGGAGGAAGTTGTAATGGCATGGAAATATTATTAAAGGGTTATGAAGAAGCATTACCTTCGCAAGTTCCTAAAGATTTGTCTTTGGATTTCCAAAAGAAAGTTACTCCTTCTAAACATGAGAGTCAAGACAGTGATGAATATTGCCAACCACTTCTAGCAGAAATGGAGAAAGAAGATCAGCTGCTAAGTCAGGTACTGCAGTCAAGAACTATAACTATGGAAAGGATAAAATCAAGTCGACAACAGTTAATCCTTGTAGCATCACTACTTGATCGCATACCTAACCTTGCTGGATTAGCACGGACATGTGAGGTATTTAAAGCAGCAGGTTTGGCCATTGCTGACGCAAGTATTATATCTGATAAGCAGTTCCAACTCATCAGTGTGACAGCTGAGAAGTGGGTCCCCATCATAGAGGTCCCACCAAGCAGTGTGAAAGTATTCTTAGAGAGAAAGAAGCGAGAGGGTTTCTCAATCCTGGGCTTAGAGCAGACGGCAAATAGTATACCTCTTGACCAATACACCTTTCCAAAAAAGACGGTTCTGGTTCTTGGTCGTGAAAAGGAGGGCATACCCGTAGATATAATCCATGTTCTAGATGCTTGTGTTGAGATTCCTCAGTTAGGAGTTGTTAGATCGCTCAATGTTCACGTCAGTGGTGCAATTGCTCTCTGGGAATATACCCGACAACAAAGATCACAAAAGTCCTGA 5541 39.9 MSTPIGDSMSSPVDSLTMSFGLVPPTAVPAILDCILSSTRLSPSLLFSSLLDAFSNVIKDDSKEEHEKLDSAYSSRIVSFASALCHLLKKSGTNPDSLRSFIWKGFFPVIKIYSNDYELLNQIAELLFAIVVETNTWGVLEATLVPICLMSIGHSLGMLQNEDSTIFQWDMQSIILESTDKLSYLNIEKELLLSHFGSLPLPVSCHILTSLLFSALRSHQAVHNTSEPVVANGCCAGNFAGKLLWHLCDMSIQILLQSSEHRFCAIHLLLPFVFRAFVSHSHFEIAVHGKKHVLSREYLFTKIWKCCKTLLSLGPLERRDAYNVLSLYLSSSLHMDGCEVSVCNGEDNLDLKSEKEFWDEIKRGLVDKEGFVRKQSFHILKTALSRSGGSQCCSGVSEATSFEKSSTSCGMTKRAQWAEKEAKSLGVGKIYNSASPCLNSQQRWDAFLLLYEMLEEYGTHLVEAAWTHQITLLLHFSCPHDYSLNSKIEGSYQFQMETLEGIFSWLAVLWERGFCHENPQVRCLIMQSFLGIDWKNHGEWAKLVPKSFVLGPFIQGLNDTVHHKDFGVKGIYSSTTIEGAASFFCQFSSYLCGRELVAFLFNLASVAKVESFGRAGLMALSVCIASAACGAEAPCEREAQLCENDSFNTVQVDSDSSEECVLSNCKADLLDALRLIIEGGKQHFNPNYRLRVCEKVLEVACSMMCPSDVPLEILMHFLSSLPREFTDFGGSFRGKVQKWFSGCNKKDNGSSTFSAKMQVLKSLHDFPKRFINHHYSHDTYDDEDLKAWALEAQRWTRLLFLVFTEEQHFEPIFMFLQNCGINICNQKENLEWIPVKFLILAFSLVQELQMVQDKYTDFTMKVRSHMAVDMPQSYDELSTEETFIVSEKVRTPFLFILEDFVSFAKSACSIFWSSPIIEDLLLPCSVRGKLGGPSQRRLASSTTMAVLQAIESIRTIASISSWCARFQNDSFLGYAFTFLWRSFARIISCPTFDSEMGAEIRLASYEALVPVLKALGSAFPLWDFNSIMTNDESLLPKLEGKPLLDSWVSNFLNNINDLLAVGILARSRRAVLMNWKWHCLDSLLSIPYHAIKNGVHLCNNATFFSDAALRCIFSDIIESLENAGENSVLPMLRSVRFVLGISASERISSLVSSCDGLDIQIMWQLVHSSWLLHVSCNKRKVAPIAALLSSVLHISVFCDESMHETADNAQGPLKWFVKKILDEGGKSPRTIRLAALHLTGLWLLYPRIIKYYIKELKLLALYGSVAFDEDFEAELAEQDARTEVLLLAKSPDPELTEAFINTELYARVCVAVLFEKLADLSDGSGLMKRNEDCSAALESGKLFLLELIDSVVNDKDLSKELYKKYSAIHRRKVRAWQMLCILSRFVDEDIVQEVTSSLHICLYRNNLPAVRQYLETFAINIYLKFPFLVREQLIPIFLDYNMRTQALSSYVFIATNIILHTSEMLLQFRHLNDLLPPIIPLLTSHHHSLRGFTQLLVYHVLCKLVPELDSDVSEVPLEKKCFQSLKSYLMKNSDCMRLRASMEGFLDVFSPKASTIPAGIFTARDEESEFECVPLSLMEQVIAFLNDAREDLRCNMAKDIVTIKNESLTIGGSCNGMEILLKGYEEALPSQVPKDLSLDFQKKVTPSKHESQDSDEYCQPLLAEMEKEDQLLSQVLQSRTITMERIKSSRQQLILVASLLDRIPNLAGLARTCEVFKAAGLAIADASIISDKQFQLISVTAEKWVPIIEVPPSSVKVFLERKKREGFSILGLEQTANSIPLDQYTFPKKTVLVLGREKEGIPVDIIHVLDACVEIPQLGVVRSLNVHVSGAIALWEYTRQQRSQKS 1846
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Nenu1g00485 1846 Pfam SpoU rRNA Methylase family 1693 1835 IPR001537 GO:0003723(InterPro)|GO:0006396(InterPro)|GO:0008173(InterPro)
Nenu1g00485 1846 Gene3D - 1674 1846 IPR029026 -
Nenu1g00485 1846 PANTHER RNA METHYLTRANSFERASE 9 1843 IPR045330 GO:0016423(PANTHER)|GO:0030488(PANTHER)
Nenu1g00485 1846 SUPERFAMILY alpha-beta knot 1686 1842 IPR029028 -
Nenu1g00485 1846 FunFam probable methyltransferase TARBP1 1688 1846 - -
Nenu1g00485 1846 CDD SpoU-like-TRM3-like 1693 1837 IPR044748 GO:0016423(InterPro)|GO:0030488(InterPro)
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Nenu1g00485 K15333 tRNA guanosine-2'-O-methyltransferase [EC:2.1.1.34]