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Gene details

leaf

Sequence information

Select Gene Cds Cds_length GC_content Pep Pep_length
Smso7g00353 ATGAGAGGAGTAATTGGGAGATACCCATCAAGTGATGGAAATGGTGAAGTGGGTGGTGCAAATGGGATCATAAAACACAACAGAAAATGCAGAGATGTTGTGTTTCTTGTTTTCTTCATAGCTTTCTGGATCGCCATGATTGTTAACTCCAGCTTCGGGTTCAACCAAGGAAACCCATTGAGGCTAAATTTCGGGTTGGATTATAAAGGAAATGTATGTGGTGGCAAACACAAAGATTTTAACCTCCATGAATTGGAACTCAAATATTATGTAAATCCTAATCAAGTTTACCAAAGTGGTTTAAAAAACAGTGGAGTAAAACTGTCTAATGCCCGAACAATATGTTTATTAGATTGCCCGATTCCATCTGAAGATTCACTAAATTGGGTTTGTGATTATCCAGAAGGAGATATCCGTATTTCGTTAGATGATTGGATCGATATGAATTATGATTATTTTGCTGACCTTACTCCAGAATTAAGAAACACTTCTCTTCAACTTCAAGGTCCTTGTTACCCTGTTATTTTTCCAAGCGTAAACGTTTATTGGACTTGCCAATTTATTGATCGGCCATCAAACGTGTCATTAACACATTGGAAACAAATGAATGGGGTTACCATTGATGATGACATGGTCATAGATAAATCTATACATAACTCCATAAATGCACGGTCTTCAGTATTGAAGAGATATGTAGCTGATGTTGGAAAATCATGGCCAGTTTTGATTGTGTGTGGAGGACTCTTGCCTCTATTTTTATCATTGCTATGGCTTTTAATGATTCGGCATTTTGTAACCGCCATGCCATGGGTTACCGTATTTTTCTTTAATGGCCTCATAATATCAGTCACAATGTTCTACTACTTGAAAGCTGGATGGATTGGAGATGATGCTATCTCGCCCATCATTGGTGAACATGATCCATATTATCATGTTTCTGCAAGAGAGCAACATCATATCCGTGCAGCTGCTTTTCTCATGACTTGTGTTATGATTGTTGCTGTTTTATCATCTATAGCTGTAGTTAGACGAATTCTTATGGCAACATCCGTACTCAAGGTTGCTGCAAAGGTGGTTGGAGAAGTTCATGCTCTAATAATATTCCCGGTTGTACCGTATTTAATCCTTGCAGTCTTTTACATGTTTTGGTTATCGGCTGCTCTCAATCTTTTTAGTTCGGGTCAAATAGCCCGCAATGATTGCAACACAAATTGTTGTGCTTATGATCTTAAAGCCAAACGGGTCAGTTGTGAGGATTGTTGTGGTTATAGCATCCATTACACCACTCACATAGCAGCTTCAATTCTATTCCACTTGTTTGGATGCTATTGGGCCACTCAGTTTATCATAGCATGTTCTTCAACTGTGATTGCGGGCTCTGTAGCTTCATACTATTGGGCTCGTGGGGAATCTTCGACAACGATTCCGGTTCTTCCGGTTTTTTCGTCAATGAAGCTACTCATGCGTTATAGCCTTGGCTCGGTGGCAATTGGTTCCTTGATTGTATCTTTTGTTGAGTCAACTCGGTTTATACTCGAGGCTGTACGACGGAGGCTTAAAGCTGCTGACATCATTCCAGAAAGTTGGATTAAAAGAATGATGTTTCATACTTCTCGGTTTTGCTTGAAATGTATTGAATTGACTGTAAAATCTGTTAACCGCAATGCGTACATCATGGTTGCTATAACAGGAAAAGGGTTTTTCAAAGCTTCTGAAACGGCTACAGATTTGATAATTAGTAATATTCTCCGTATAGGCAAAGTGAATGTAATCGGGGACGTGATTCTGTTTCTAGGAAAGCTATGTGTGAGTCTTGCAAGTGCACTTTTCGCATTTCTGATGCTGGATACTCATAAATACAAATCATCTCACAACAAGATCACATCCCCATTATTTCCGGTGCTGGTGTGTTGGGGTTTAGGATATGTGGTAGCAACCCTTTTCTTTGCAGTGGTGGAGATGTCAATTGATACTATTATACTTTCATATTGCCAGGATGCAGATGAACATCAAGGGACTGCACATTATGCGCCTCCACTTTTGATTGAAACATTTGATGAACAAAATGAGGTACAAAGAATTGCACAATAA 2091 39.12 MRGVIGRYPSSDGNGEVGGANGIIKHNRKCRDVVFLVFFIAFWIAMIVNSSFGFNQGNPLRLNFGLDYKGNVCGGKHKDFNLHELELKYYVNPNQVYQSGLKNSGVKLSNARTICLLDCPIPSEDSLNWVCDYPEGDIRISLDDWIDMNYDYFADLTPELRNTSLQLQGPCYPVIFPSVNVYWTCQFIDRPSNVSLTHWKQMNGVTIDDDMVIDKSIHNSINARSSVLKRYVADVGKSWPVLIVCGGLLPLFLSLLWLLMIRHFVTAMPWVTVFFFNGLIISVTMFYYLKAGWIGDDAISPIIGEHDPYYHVSAREQHHIRAAAFLMTCVMIVAVLSSIAVVRRILMATSVLKVAAKVVGEVHALIIFPVVPYLILAVFYMFWLSAALNLFSSGQIARNDCNTNCCAYDLKAKRVSCEDCCGYSIHYTTHIAASILFHLFGCYWATQFIIACSSTVIAGSVASYYWARGESSTTIPVLPVFSSMKLLMRYSLGSVAIGSLIVSFVESTRFILEAVRRRLKAADIIPESWIKRMMFHTSRFCLKCIELTVKSVNRNAYIMVAITGKGFFKASETATDLIISNILRIGKVNVIGDVILFLGKLCVSLASALFAFLMLDTHKYKSSHNKITSPLFPVLVCWGLGYVVATLFFAVVEMSIDTIILSYCQDADEHQGTAHYAPPLLIETFDEQNEVQRIAQ 696
leaf

Annotation information

Select Seq ID Length Analysis Description Start End IPR GO
Smso7g00353 696 PANTHER CHOLINE TRANSPORTER-LIKE (SLC FAMILY 44) 21 689 IPR007603 GO:0022857(InterPro)|GO:0055085(InterPro)
Smso7g00353 696 Pfam Plasma-membrane choline transporter 326 667 IPR007603 GO:0022857(InterPro)|GO:0055085(InterPro)
leaf

Pathway information

Select Query KO Definition Second KO KEGG Genes ID GHOSTX Score
Smso7g00353 - -
leaf

Duplication type information

Select Gene1 Location1 Gene2 Location2 Duplicated-type
Smso Smso-Chr13:30522177 Smso7g00353 Smso-Chr7:5852535 dispersed
Smso Smso-Chr2:8717061 Smso7g00353 Smso-Chr7:5852535 dispersed
Smso Smso-Chr2:13659070 Smso7g00353 Smso-Chr7:5852535 dispersed
Smso Smso-Chr13:30524321 Smso7g00353 Smso-Chr7:5852535 transposed
Smso Smso-Chr29:5983556 Smso7g00353 Smso-Chr7:5852535 wgd